معلومة

ما هو النبات الذي قمت بجمعه؟


لقد جمعت هذا النبات من التربة في حديقة في بلجيكا. اعتقدت أنه كان طفلًا لنبتة كانت تنمو في مكان قريب ، لكن عندما بدأت الأوراق تنمو أدركت أنها نبتة مختلفة.

عندما كنت أقوم بجمعها ، كانت في مرحلة وجود أوراق البذور فقط (التي لا تزال مرئية في الصورة) والتي كانت ممدودة وطولها حوالي 2.5 سم. في الحديقة ، على الأرض التي جمعتها ، كانت هذه النباتات تنمو بكميات كبيرة بالقرب من بعضها البعض. بعد حوالي أسبوع من إعادته إلى المنزل ، بدأت الأوراق في الظهور. الآن بعد حوالي 3 أسابيع يبلغ طول الأوراق حوالي 2-3 سم.

هل يمكنك مساعدتي في التعرف عليه؟

مزيد من القرائن

بادئ ذي بدء ، هذا النبات متوفر بكثرة في الحديقة ولكن يمكنني أيضًا اكتشافه في أماكن أخرى ، على سبيل المثال بالقرب من الأرصفة على مسافة قريبة من هذه الحديقة.

هذا هو النبات الموجود في البيئة الأصلية حيث جمعته:

يمكنني أيضًا أن أجده ينمو في جيب شجرة - وهذا يوحي لي أن البذور ربما تكون قد سقطت من ارتفاع ، لذلك قد يكون هذا النبات شجرة (؟)

يسكن الثوم البري إلى حد كبير أرض الحديقة. بخلاف ذلك ، بعض النباتات القريبة هي شعاع البوق والبيلسان.

إليك بعض الصور الإضافية للنباتات المحيطة التي قد تكون تلميحًا لك:


لديك بالتأكيد نبتة ذات فلقة بارزة لا تزال موجودة.

تخميني الأولي هو أيسر pseudoplatanus (الجميز القيقب، أو تسمى فقط "شجر جميز"أو" بلانيتري القيقب "في أجزاء من أوروبا)

المصدر: ويكيميديا

يمكنك رؤية صورة مفصلة لملف A. pseudoplatanus نبتة هنا وفاصل زمني لبذرة تنمو إلى حد إطلاق النبتة في فيديو نيل برومهول على YouTube.

وفقًا لخريطة النطاق المتوفرة من Euforgen ، A. pseudoplatanus موجود (أزرق) في جميع أنحاء بلجيكا:

بالنسبة لتأكيد البالغين القريبين ، فأنت تبحث عن شجرة تبدو كالتالي:

المصدر: حضانة بلو ريفر

لمزيد من المعلومات حول تحديد الشخص البالغ ، يرجى الاطلاع على Virginia Tech Dendrology


علماء الأحياء يجدون Vaterite المعدنية النادرة وغير المستقرة في نباتات جبال الألب

وجد فريق من علماء الأحياء من جامعة كامبريدج بالمملكة المتحدة ، أن معدنًا نادرًا وغير مستقر للغاية يُدعى vaterite هو عنصر مهيمن في القشرة الواقية ذات اللون الأبيض الفضي والتي تتشكل على أوراق عدد من نباتات جبال الألب. تم نشر النتائج في المجلة النباتية.

Saxifraga sempervivum، وهو نوع من نباتات جبال الألب في الحدائق النباتية بجامعة كامبريدج ، "ينتج vaterite النقي". حقوق الصورة: بول أستون.

نادرًا ما يوجد vaterite الموجود بشكل طبيعي & # 8212 وهو شكل (متعدد الأشكال) من كربونات الكالسيوم & # 8212 على الأرض.

تم العثور على كميات صغيرة من بلورات vaterite في بعض قشريات البحر والمياه العذبة وبيض الطيور والأذن الداخلية لسمك السلمون والنيازك والصخور.

هذه هي المرة الأولى التي يتم فيها العثور على هذا المعدن بهذه الكمية الكبيرة والمرة الأولى التي يتم فيها العثور على هذا المعدن مرتبطًا بالنباتات.

قال الدكتور ريموند وايتمان ، المؤلف الرئيسي للدراسة: "غالبًا ما كان فاتريت مرتبطًا بالفضاء الخارجي وقد تم اكتشافه في أجسام كوكبية في النظام الشمسي والنيازك".

& # 8221 Vaterite ليس مستقرًا جدًا في الغلاف الجوي الرطب للأرض لأنه غالبًا ما يعود إلى أشكال أكثر شيوعًا من كربونات الكالسيوم ، مثل الكالسيت. وهذا يجعل الأمر أكثر إثارة للإعجاب أننا وجدنا فاتريت بكميات كبيرة على سطح أوراق النبات. "

كان Vaterite ذا أهمية بالنسبة لصناعة الأدوية. يعمل علماء الكيمياء الحيوية على تصنيع مادة vaterite صناعياً حيث يمكن استخدامها في توصيل الأدوية ، ولكن ليس من السهل صنعها ".

"يتمتع Vaterite بخصائص خاصة تجعله ناقلًا متفوقًا للأدوية نظرًا لقدرته على التحميل العالية ، وامتصاصه العالي من قبل الخلايا وخصائصه القابلة للذوبان التي تمكنه من تقديم إطلاق مستدام وموجه للأدوية العلاجية للمرضى."

"على سبيل المثال ، يبدو أن الجسيمات النانوية للفايتريت المحملة بالعقاقير المضادة للسرطان تفرغ الدواء ببطء فقط في مواقع السرطانات ، وبالتالي تحد من الآثار الجانبية السلبية للدواء."

بدأ الدكتور ويتمان وزملاؤه ، بول أستون وسيمون واليس ، بأخذ عينات من مجموعة واسعة من الأنواع داخل الجنس ساكسيفراجا بقدر الإمكان.

جاء التحليل المجهري للمواد النباتية باكتشاف أن بعض النباتات كانت تنضح فاتريت من "غدد الطباشير" (الهيداثود) على هوامش أوراقها.

ثم لاحظنا ظهور نمط. كانت النباتات المنتجة للفيتريت من قسم ساكسيفراجا تسمى البورفيريون. علاوة على ذلك ، يبدو أنه على الرغم من أن العديد من الأنواع في هذا القسم أنتجت vaterite مع الكالسيت ، إلا أنه كان هناك نوع واحد على الأقل ، Saxifraga sempervivumقال واليس.

فلماذا تنتج هذه الأنواع قشرة بلورية من كربونات الكالسيوم ولماذا تكون بعض قشور الكالسيت وغيرها؟

يأمل مؤلفو الدراسة في الإجابة على هذا السؤال من خلال مزيد من التحليل لتشريح ورقة ساكسيفراجا مجموعة.

"نشك في أن الياتيريت قد يكون موجودًا في المزيد من الأنواع النباتية ، لكن المعدن غير المستقر يتحول إلى كالسيت عند تعرضه للرياح والأمطار. وقالوا إن هذا قد يكون أيضًا سبب وجود كل من الاتيرايت والكالسيت في بعض النباتات في نفس الوقت.

كشف البحث المجهري أيضًا عن بعض الهياكل الخلوية الجديدة.

"بالإضافة إلى إنتاج vaterite ، Saxifraga scardica يحتوي على نسيج خاص يحيط بحافة الورقة يبدو أنه يحرف الضوء من الحافة إلى الورقة. يبدو أن الخلايا تنتج هياكل جديدة لجدار الخلية لتحقيق هذا الانحراف. قد يكون هذا لمساعدة النبات على جمع المزيد من الضوء ، لا سيما إذا كان ينمو في بيئات مظللة جزئيًا ، "قال أستون.

يعتقد الباحثون أن الهياكل الجديدة لجدار الخلية في Saxifrages يمكن أن تساعد يومًا ما في إعلام صناعة الأجهزة البصرية الجديدة المستوحاة من الحياة والهياكل الضوئية للصناعة مثل كابلات الاتصالات والألياف الضوئية.

قال أستون: "نتوقع أنه قد تكون هناك نباتات أخرى تنتج أيضًا مادة vaterite ولها تشريح خاص للأوراق تطورت في بيئات قاسية مثل مناطق جبال الألب".

"النوع التالي الذي نتطلع إلى دراسته هو Saxifraga lolaensis، الذي يحتوي على أوراق صغيرة جدًا مع تنظيم من أنواع الخلايا لم يسبق له مثيل في ورقة ، والذي نعتقد أنه سيكشف المزيد من الأسرار الرائعة حول تعقيد النباتات. "


علم النبات

علم النباتات. يشتمل علم النبات على مجموعة واسعة من الموضوعات: الانتظام في البنية الخارجية والداخلية للنباتات (مورفولوجيا وعلم التشريح) تصنيفها ، التطور في سياق الزمن الجيولوجي (التطور) ، والعلاقات المتبادلة (نسالة) وخصائص توزيعها في الماضي والحاضر فوق سطح الأرض و rsquos (جغرافيا النبات) علاقتهم المتبادلة مع بيئتهم (بيئة النبات) تكوين الغطاء النباتي (علم النبات أو علم النبات) وإمكانيات ووسائل استخدام النباتات اقتصاديًا (دراسة الموارد النباتية ، أو علم النبات الاقتصادي). ينقسم علم النبات إلى فئات حسب موضوع البحث: علم النبات أو علم الطحالب ، ودراسة فطريات الطحالب ، ودراسة علم الأشنة الفطرية ، ودراسة الأشنات وعلم الأحياء ، ودراسة الطحالب. تعتبر دراسة الكائنات الحية الدقيقة من عالم النبات (البكتيريا ، الفطريات الشعاعية ، بعض الفطريات ، والطحالب) علمًا منفصلاً يسمى علم الأحياء الدقيقة. يتم دراسة أمراض النباتات التي تسببها الفيروسات والبكتيريا والفطريات في مجال علم الأمراض النباتية.

النظام النباتي الأساسي ، تصنيف النباتات ، يقسم الأشكال المتنوعة للمملكة النباتية إلى مجموعات طبيعية منسقة بشكل متبادل ، أو أصناف (تصنيفات) ، يؤسس نظامًا عقلانيًا لتسميتها (التسمية) ، ويشرح الأسرة (التطورية) العلاقات المتبادلة بين لهم (نسالة). في الماضي ، كان التصنيف يعتمد على الخصائص المورفولوجية الخارجية للنباتات وتوزيعها الجغرافي. يستخدم نظام التصنيف الآن أيضًا خصائص البنية الداخلية للنباتات وخصائص بنية الخلية النباتية وجهاز الكروموسومات ، فضلاً عن التركيب الكيميائي والخصائص البيئية للنباتات. عادةً ما يُطلق على إنشاء تكوين الأنواع للحياة النباتية (فلورا) لمنطقة معينة اسم علم الأزهار ، ويسمى توضيح مناطق التوزيع (مناطق) الأنواع الفردية والأجناس والعائلات chorology (علم النبات). يتم تخصيص دراسة الأشجار والشجيرات أحيانًا إلى تخصص منفصل هو علم الشجرة.

يرتبط تصنيف النبات ارتباطًا وثيقًا ، حيث يدرس شكل النباتات في عملية التطور الفردي (تطور الجنين) والتطور التاريخي (تطور نسالة). بالمعنى الضيق ، تدرس علم التشكل الشكل الخارجي للنباتات وأجزائها. بمعنى أوسع ، يشمل علم التشكل تشريح النبات ، الذي يدرس البنية الداخلية لعلم أجنة النباتات ، الذي يبحث في تكوين وتطور النبات الجنيني وعلم الخلايا ، الذي يدرس بنية الخلايا النباتية. تنقسم بعض فروع مورفولوجيا النبات إلى تخصصات خاصة وفقًا لأهميتها التطبيقية أو النظرية: يصف علم النبات أجزاء وأعضاء النباتات ودراسات علم الحفريات النباتية وحبوب اللقاح والجراثيم. هناك مجالات منفصلة من مورفولوجيا النبات المقارنة والتطورية والبيئية.

يتم إجراء دراسة النباتات في علاقتها المتبادلة مع بيئتها من خلال العديد من فروع علم النبات التي توحد أحيانًا تحت العنوان العام لبيئة النبات. بالمعنى الضيق ، تدرس البيئة تأثير البيئة على النبات بالإضافة إلى التكيفات المختلفة للنباتات مع خصوصيات تلك البيئة. على سطح الأرض و rsquos ، تشكل النباتات روابط محددة ، أو phytocoenoses ، والتي تتكرر في مناطق أكثر أو أقل أهمية (الغابات ، السهوب ، المروج ، والسافانا). يُطلق على فرع علم النبات الذي يدرس هذه الارتباطات اسم علم النبات الجغرافي في الاتحاد السوفياتي ، أو علم النبات في الخارج ، وغالبًا ما يُطلق عليه علم الاجتماع النباتي. اعتمادًا على موضوع البحث ، يتم تقسيم علم النبات إلى دراسة الغابات ، ودراسة المروج ، ودراسة التندرا ، ودراسة المستنقعات ، وما إلى ذلك. بمعنى أوسع ، يتكون علم النبات الجيولوجي من دراسة النظم البيئية ، أو علم البيئة الحيوية ، الذي يدرس العلاقات المتبادلة بين الغطاء النباتي والحيوانات والتربة والصخور الأساسية. هذا المركب يسمى التكاثر الحيوي. تتم دراسة توزيع الأنواع الفردية من النباتات على سطح الأرض ورسكووس من خلال جغرافيا النبات ، وخصائص توزيع الغطاء النباتي على الأرض فيما يتعلق بالظروف المعاصرة والماضي التاريخي تتم دراستها بواسطة الجغرافيا النباتية.

علم النباتات الأحفورية و mdashpaleobotany أو phyto-paleontology و mdashhas أهمية أساسية في إعادة بناء تاريخ تطور المملكة النباتية. تعتبر بيانات علم النبات القديم مهمة للغاية في حل العديد من مشاكل تصنيف النبات ، والتشكل (بما في ذلك علم التشريح) ، والجغرافيا التاريخية للنباتات. هذه المعلومات مفيدة أيضًا في الجيولوجيا (الجغرافيا التاريخية والطبقات الأرضية).

يتم دراسة الخصائص المفيدة للنباتات البرية وإمكانيات زراعتها من خلال علم النبات الاقتصادي (دراسة الموارد النباتية). يرتبط علم النبات العرقي ، الذي يدرس استخدام النباتات من قبل مجموعات عرقية مختلفة من سكان العالم ، ارتباطًا وثيقًا بعلم النبات الاقتصادي. فرع مهم من علم النبات التطبيقي هو دراسة النباتات البرية المتعلقة بالنباتات المزروعة. هذه النباتات البرية لها خصائص قيمة (مثل المناعة ضد الأمراض ، ومقاومة الجفاف ، وما إلى ذلك).

لا يُنظر دائمًا إلى فسيولوجيا النبات والكيمياء الحيوية على أنها فرع من فروع علم النبات لأن العديد من العمليات الفسيولوجية والكيميائية الحيوية التي تحدث في النباتات مماثلة أو حتى متطابقة مع تلك التي تحدث في الكائنات الحية الحيوانية ويمكن دراستها بطرق مماثلة. ومع ذلك ، فإن فسيولوجيا النبات والكيمياء الحيوية للنبات تتميز بعدد من السمات المحددة التي تخص النباتات بشكل حصري أو شبه حصري. لهذا السبب ، ليس من السهل فصل فسيولوجيا النبات والكيمياء الحيوية عن علم النبات خاصة وأن الخصائص الفسيولوجية والكيميائية الحيوية للنباتات يمكن اعتبارها سمات تصنيفية مثيرة للاهتمام بالنسبة لأولئك الذين يصنفون النباتات. هذه الخصائص مهمة للغاية لفهم مشاكل البيئة وعلم النبات ، وجغرافيا النبات والجغرافيا النباتية ، وعلم النبات الاقتصادي ، وما إلى ذلك. يعتبر علم الوراثة النباتية عادةً قسمًا من علم الوراثة العام ، على الرغم من أن العديد من فروعها (علم الوراثة السكانية وعلم الوراثة الخلوية) ترتبط ارتباطًا وثيقًا بالتصنيف و [مدش] خاصة النظم الحيوية و [مدش] وبيئة النبات وعلم النبات.

الحدود بين أقسام علم النبات المذكورة أعلاه تعسفية إلى حد كبير. تتداخل أساليبهم كثيرًا ويستخدمون نفس البيانات. من الصعب تحديد مكان العلوم مثل علم التشريح الفسيولوجي وعلم وظائف الأعضاء الإيكولوجي أو التمييز بين استخدام الخصائص الكيميائية للنباتات في التصنيف (النظام الكيميائي) والكيمياء الحيوية النباتية المقارنة. بالإضافة إلى ذلك ، هناك تخصص ضيق للغاية للأقسام الفردية لعلم النبات.

يرتبط علم النبات ارتباطًا وثيقًا بالعديد من العلوم الأخرى. يرتبط بالجيولوجيا من خلال علم النبات القديم وعلم النبات الجغرافي (استخدام ميزات بعض النباتات وبيئتها كمؤشرات لبعض الحفريات المفيدة) مع الكيمياء ، من خلال الكيمياء الحيوية ، وعلم وظائف الأعضاء ، وعلم النبات الاقتصادي ، وعلم العقاقير مع علم التربة والجغرافيا الفيزيائية ، من خلال علم البيئة وعلم النبات ومع العلوم التقنية ، من خلال علم النبات الاقتصادي. علم النبات هو أساس التاريخ الطبيعي للزراعة والغابات ، فضلاً عن المناظر الطبيعية في المدن والمنتجعات الصحية والمتنزهات. يحل علم النبات أيضًا العديد من المشكلات في صناعات الأغذية والمنسوجات والسليلوز والورق والميكروبيولوجية وصناعات الأخشاب. ومع ذلك ، فإن أهم مهمة لعلم النبات هي دراسة قوانين التنمية والحفاظ على بيئة الإنسان و rsquos و mdashthe المحيط الحيوي و mdashand ، وقبل كل شيء ، في المملكة النباتية ، الغلاف النباتي.

يستفيد علم النبات من الملاحظة ، فضلاً عن الأساليب المقارنة والتاريخية والتجريبية ، بما في ذلك جمع المجموعات وتجميعها ، والملاحظات في الميدان وفي المحطات التجريبية ، والتجارب في الطبيعة وفي ظل ظروف معملية متخصصة ، والمعالجة الرياضية للبيانات التي تم الحصول عليها . جنبًا إلى جنب مع الأساليب الكلاسيكية لتسجيل السمات المميزة للنباتات قيد الدراسة ، يستخدم علم النبات أيضًا ترسانة كاملة من أساليب البحث الكيميائية والفسيولوجية والسيبرانية المعاصرة ، بالإضافة إلى الأساليب الكلاسيكية لتسجيل السمات المميزة المختلفة للنباتات قيد الدراسة .

المراحل الأساسية في تطور علم النباتأصول النبات. تطور علم النبات كنظام منظم للمعرفة حول النباتات في القرنين السابع عشر والثامن عشر. ومع ذلك ، حتى الإنسان البدائي كان يعرف الكثير عن النباتات ، لأن حياته كانت مرتبطة بالنباتات المفيدة ، وخاصة تلك التي تستخدم في الغذاء والدواء والسموم. النصوص التي يمكن اعتبارها نباتية إلى حد ما معروفة من الآثار الأدبية القديمة لبلاد ما بين النهرين (سومر وبابل وآشور) ووادي النيل (مصر القديمة). هذه النصوص وكذلك الكتاب الصيني الأسطوري عن الأعشاب ، القلم ts و rsquoao ، الذي يعود تاريخه إلى نهاية الألفية الثالثة قبل الميلاد.، هي أعمال في علم النبات التطبيقي ، أي أنها تحتوي بشكل أساسي على معلومات عن النباتات الغذائية والطبية. الكتب الأولى التي وصفت فيها النباتات فيما يتعلق بأكثر من فائدتها هي أعمال العلماء اليونانيين أرسطو ، وعلى وجه الخصوص تلميذه ثيوفراس توس ، الذي قام بأول محاولة في تاريخ العلم لتصنيف النباتات بتقسيمها إلى الأشجار والشجيرات وأشباه الشجيرات والأعشاب. قام بعمل المزيد من التقسيمات الفرعية في مجموعة الأعشاب للنباتات المعمرة ، كل سنتين ، والسنوية. كان ثيوفراستوس يُدعى أبو علم النبات. قدم بشكل واضح بنية الزهرة ، ولا سيما موقع المبيض فيها ، وميز بين الكورولا الجامو البتلة والكورولا متعددة الفلزات. في استعلام عن النباتات ووصف حوالي 480 نبتة. في تاريخ طبيعي استشهد عالم الطبيعة الروماني بليني الأكبر بجميع المعلومات عن الطبيعة المعروفة لمعاصريه. ذكر حوالي 1000 نوع من النباتات ووصفها بدقة تامة.

خلال ما يقرب من 1500 عام بعد زمن ثيوفراستوس وبليني الأكبر ، حدث تراكم المعرفة حول النباتات في المقام الأول خارج أوروبا. في الهند في الألفية الأولى قبل الميلاد ما يسمى ب أيور فيدا ، أو معرفة الحياة ظهر. تضمنت وصفًا للعديد من النباتات الطبية في الهند. التعليقات والإضافات إلى ايور فيدا ترد في أعمال الأطباء الهنود شاراكا (من القرن العاشر إلى الثامن قبل الميلاد) ، وسسروتا ، وفادباكا (من القرن الثامن إلى القرن السابع قبل الميلاد.). التوسع العربي في النصف الثاني من الألفية الأولى ميلادي. وسعت بشكل كبير آفاق العصور القديمة. أعمال عالم Tadzhik ابن سينا ​​(Avi-cenna) ، الذي وصف العديد من النباتات التي لم تكن معروفة من قبل للأوروبيين في العمل قانون الطب لها أهمية خاصة. كان الإنجاز الوحيد للعلوم الأوروبية في مجال علم النبات هو عمل الفيلسوف وعالم الطبيعة الألماني ألبرت فون بولست وأوملت (ألبرت العظيم). استند عمله بشكل خاص على تحديد الفرق بين الهياكل الجذعية للنباتات أحادية الفلقة والنباتات ثنائية الفلقة.

النبات في نهاية الأعمار المتوسطة. خلال عصر الاكتشافات العظيمة ، انتعش الاهتمام بالنباتات كمصادر للأدوية والتوابل والمنتجات الغذائية الجديدة. ظهرت الأعشاب وسرعان ما تم نشرها ووصفت عددًا متزايدًا من النباتات. تم إنشاء الحدائق الأولى & ldquodried ، & rdquo أو herbaria ، وتم تنظيم حدائق نباتية حقيقية. كل هذا سهّل تراكم الحقائق الجديدة وخلق المفاهيم العامة الأولى ، خاصة في مجال تصنيف النبات. وهكذا ، قام عالم النبات الألماني O. Brunfels بتميز & ldquocomplete & rdquo النباتات ، أو تلك التي تحتوي على أزهار ، من & ldquoincomplete & rdquo ، أو تلك التي لا تحتوي على أزهار. نشر الطبيب وعالم النبات الإيطالي أ. سيسالبينو (أو Caesalpinus باللاتينية) أهم عمل نباتي في ذلك العصر ، الكتاب على النباتات. حاول في مقدمته تصنيف النباتات. إلى التقسيم التقليدي للنباتات إلى أشجار وشجيرات وأعشاب ، أضاف معلومات حول سمات الأزهار والفواكه والبذور. وصف عالم النبات السويسري يوهان بوهين (جان بوهين) حوالي 5000 نبتة في بلده التاريخ العالمي للنباتات نُشر بعد وفاته في عام 1650. يدين علم النبات إلى أخيه ، غاسبارد بوهين ، بإنشاء تسمية ذات الحدين و mdasht أي تسمية كل نبات بكلمتين ، الأولى تشير إلى الجنس ، والثانية ، النوع. كما هو معروف جيدًا ، تم تدوين نظام تسمية النباتات هذا لاحقًا بواسطة C.Linnaeus ولا يزال موجودًا حتى اليوم.

النبات في القرنين السادس عشر والسابع عشر. يتميز القرنان السادس عشر والسابع عشر بأكثر من مجرد تطوير التصنيف. أدى اختراع المجهر إلى اكتشاف التركيب الخلوي للنباتات. تم إجراء الملاحظات الأولى في هذا المجال من قبل العالم الإنجليزي R. Hooke. في وقت لاحق ، وضع الإيطالي M. Malpighi والإنجليزي N. Grew أسس تشريح النبات. أجرى الهولندي جي بي فان هيلمونت أول تجربة في فسيولوجيا النبات. قام بزراعة غصن صفصاف في برميل وتأكد من أن زيادة الوزن بما يقارب 40 ضعف الوزن الأصلي على مدى خمس سنوات لم تكن مصحوبة بأي انخفاض كبير في وزن التربة. أثبت عالم النبات الألماني ر. كاميراريوس لأول مرة وجود عمليات جنسية في النباتات.

في روسيا في القرنين الخامس عشر والسابع عشر ، أوصاف النباتات الطبية (أعشاب ، أو العمود الفقري ، كما كانت تسمى آنذاك) من اليونانية واللاتينية واللغات الأوروبية ، وأعيد كتابتها وطباعتها لاحقًا. تم نشر العديد من هذه مع سرد للظروف المحلية. كانت الإضافات إلى هذه الأعمال في المقام الأول مؤشرات على أماكن منشأ النباتات (على سبيل المثال ، ينمو نبات ldquothis في Rus & rsquo في Dragomilov & rdquo).

النبات في القرن الثامن عشر. أدت الاكتشافات في مختلف مجالات علم النبات في القرن الثامن عشر والعمل على المفاهيم المختلفة إلى نتائج لاحقة. ومع ذلك ، يمكن وصف هذا القرن أساسًا بأنه قرن من التصنيف النباتي ويرتبط في المقام الأول باسم عالم النبات السويدي C. Linnaeus. جعل هيكل الزهرة أساس نظامه الاصطناعي ، قسم لينيوس المملكة النباتية إلى 24 فئة. لم يعمر نظام Linnaeus & rsquo لفترة طويلة بعده ، ولكن له أهمية كبيرة في تاريخ علم النبات. لأول مرة ، تبين أنه يمكن وضع كل مصنع في فئة محددة تتوافق مع سماته المميزة. كان العمل الجبار حقًا الذي قام به لينيوس أساس جميع التحقيقات اللاحقة في مجال تصنيف النباتات. لينيوس و rsquo المعاصرين الأصغر سنًا و mdashthe الفرنسي M. راي ، ك. بوهين ، وجي تورنفورت). لقد وضعوا تصنيفًا طبيعيًا للنباتات التي كان فيها & ldquorelationhip & rdquo أساسًا لمجموعة منهجية أو أخرى. في هذا السياق ، فإن المصطلح & ldquorelationhip & rdquo يعني تقاربًا غير محدد و ldquonatural. & rdquo

أعطى علماء الطبيعة البارزون في القرن الثامن عشر اهتمامًا كبيرًا للمسائل العامة في علم النبات. وهكذا ، في بلده نظرية الجيل (1759) ، وصف الأكاديمي الروسي K.F Vol & rsquof عملية تطور الأعضاء في النباتات وتحول بعض الأعضاء إلى أعضاء أخرى. اهتمت هذه الأفكار بشكل خاص بالشاعر جوته. في عام 1790 نشر الكتاب تحول النباتات ، المليء بالرؤى الرائعة. تم إثبات وجود الجنس في النباتات بالتأكيد من قبل عالم النبات الألمان J. K & oumllreuter و C. Sprengel. حصل K & oumllreuter على أنواع هجينة متعددة الأنواع من التبغ ووليام الحلو ونباتات أخرى ودرسها بعناية ، كما قام بفحص تلقيحها بواسطة الحشرات. نشر Sprengel الكتاب لغز الطبيعة الذي تم الكشف عنه حديثًا في بنية الأزهار وتخصيبها (1793).

في القرن الثامن عشر ، حدث تطور سريع في البحث العلمي في روسيا ، لا سيما في أكاديمية العلوم في سانت بطرسبرغ ، التي أسسها بيتر الأول الأكبر. تم جمع المجموعات النباتية لأول مرة في Kunstkamera. في عام 1714 ، تم تنظيم Aptekarskii Ogorod (الحديقة الصيدلانية) وكان هذا أساسًا لحديقة النباتات الإمبراطورية المستقبلية والمعهد النباتي الحديث. كان للبعثات الجغرافية لأكاديمية العلوم أهمية خاصة لتطوير علم النبات الروسي والعالمي. كان من بين المشاركين في هذه البعثات عالم النبات س.ب. كراشينينيكوف ، الذي نشر وصف الأرض كامتشاتكا ، و I.G.Gmelin ، مؤلف المجلد الأربعة فلورا سيبيريا واحدة من النباتات الأولى في هذه المنطقة الواسعة. تم تجميع أعمال قيمة حول النباتات في مناطق مختلفة من روسيا ، بما في ذلك بيانات حول النباتات المفيدة ، بواسطة I. Ozeretskovskii ، P. S. Pallas ، و K. F. Ledebur.

النبات في القرنين التاسع عشر والعشرين. تميز القرن التاسع عشر بالتطور السريع للعلوم الطبيعية ككل. نمت جميع فروع علم النبات بسرعة. كان لنظرية التطور داروين ورسكووس تأثير حاسم على التصنيف. قبلها معظم العلماء ، قدمت نظرية داروين ورسكوس مشكلة إنشاء نظام نسبي للمملكة النباتية يعكس المراحل المتعاقبة لتطور النباتات. تم اقتراح الأنظمة الأولى من القرن التاسع عشر من قبل علماء النبات السويسريين AP de Candolle وابنه A. de Candolle وعلماء النبات الإنجليز G. Bentham و W. ). لم تأخذ هذه الأنظمة في الاعتبار مشكلة اشتقاق مجموعة واحدة من النباتات من مجموعات أخرى ، لكنها جاهدت من أجل الحد الأقصى & ldquonaturalness & rdquo & mdasht أي ، لتجميع النباتات الأكثر تشابهًا مع بعضها البعض في أهم ميزاتها التنظيمية. تعمل هذه الأنظمة مع عدد كبير من المصانع من جميع القارات تقريبًا (خاصة بنثام وهوكر ورسكووس ، وإلى حد ما ، دي كاندول ورسكووس) بشكل منطقي لدرجة أنها استمرت حتى الوقت الحاضر. استمر نظام Bentham and Hooker & rsquos باللغة الإنجليزية وإلى حد ما في الدوائر النباتية بأمريكا الشمالية ، بينما استمر نظام de Candolle & rsquos بين علماء النبات في البلدان الناطقة بالفرنسية.

ومع ذلك ، فإن المستقبل ينتمي إلى أنظمة النشوء والتطور ، والتي جمع أولها عالم النبات الألماني أ. دبليو أيكلر ونُشر في عام 1875. كان النظام الأكثر استخدامًا هو نظام عالم النبات الألماني أ. حمل هو وزملاؤه نظام تصنيف النباتات فيما يتعلق بالأجناس ، وحتى الأنواع في بعض الحالات ، في العمل المكون من 20 مجلدًا عائلات النباتات الطبيعية (1887 و - 1911). أظهرت الأبحاث التي أجريت بشكل أساسي في النصف الأول من القرن العشرين أن غالبية المبادئ التي اقترحها إنجلر كأساس لنظامه كانت خاطئة ، ولكن لا ينبغي الاستهانة بعمله. كان معارضو آراء إنجلر ورسكووس عالم النبات الأمريكي سي بيسي ، والألماني هـ. هال-لير ، والإنجليزي جيه. هاتشينسون. كان أساس خلافهم مع إنجلر يتعلق بتصنيف كاسيات البذور (النباتات المزهرة). كانوا يعتقدون أن النباتات متعددة الصور (مثل الماغنوليا) كانت أكثر مجموعة بدائية من كاسيات البذور. يعتقد إنجلر أن أحادية الفلقة كانت المجموعة الأصلية من كاسيات البذور وما يسمى بالنباتات المزهرة بالقطينة (مثل الصفصاف والحور) كانت أكثر ثنائيات الفلقة بدائية. وكان من بين خصومه أيضًا علماء النبات الروس خ. I ل. جوبي ، ب.م.كوزو بوليانسكي ، أ.أ.جروسجيم ، وآخرون. في السنوات الأخيرة كان هناك بعض الإجماع في آراء علماء النبات حول مبادئ بناء تصنيف للنباتات العليا. حصل النظام الذي وضعه عالم النبات السوفيتي أ.ل.تاختادجيان على اعتراف واسع النطاق.

لم يتم إيلاء اهتمام أقل للنباتات السفلية خلال القرن التاسع عشر وبداية القرن العشرين. نتيجة لعمل عالم الفطريات CH Person ، الذي عمل في ألمانيا وفرنسا ، عالم الأشنات السويدي E. Acharius ، وعلماء النبات الروس LS Tsenkovskii و IN Goro-zhankin ، وعلماء الفطريات الألمان A. de Bary و O. Bre-feld ، عالم الفطريات الروسي MS Voronin ، عالم النبات السوفيتي AA Iachevskii ، والعديد من الآخرين ، تم جمع معلومات شاملة عن الطحالب والفطريات والأشنات. هذا لم يسهّل فقط بناء تصنيفها المنطقي ولكن أيضًا تقييم أهميتها في المحيط الحيوي. خضع علم الفطريات على وجه الخصوص للتطور ، في المقام الأول فيما يتعلق بأهمية الفطريات كأسباب لأمراض النباتات الزراعية. كما ارتبط تطوير علم الأمراض النباتية كتخصص خاص بهذا.

ترتبط دراسة توزيع النباتات على الأرض بالقرن التاسع عشر وأوائل القرن العشرين. كان مؤسس جغرافيا النبات عالم الطبيعة الألماني أ. همبولت ، مؤلف سلسلة من الأعمال ، وأشهرها في القوانين المرصودة في توزيع النباتات (المجلدان 1 و ndash2 ، 1816). تم إجراء المحاولة الأولى لوصف حياة نباتات الأرض ورسكووس فيما يتعلق بالظروف المناخية من قبل العالم الألماني A.Grisebach في عمله. الحياة النباتية للأرض. (1872). ربط عالم النبات الدنماركي إي. تدفئة توزيع النباتات بظروف معيشية معينة. كتابه، الجغرافيا البيئية للنباتات (1896) ، كان أساس العلم الجديد لبيئة النبات.

في الوقت نفسه ، طوال القرن التاسع عشر ، قام مئات الباحثين بعمل شاق في تجميع الأزهار الإقليمية. ومن أهم هذه الأعمال E. Boissier & rsquos خمسة مجلدات فلورا من الشرق (1867 & ndash88) و J. Hooker & rsquos سبعة مجلدات فلورا الهند البريطانية (1875 و ndash97). العمل الأساسي في هذا المجال هو 30 مجلد فلورا من اتحاد الجمهوريات الاشتراكية السوفياتية (1934 & ndash64) ، الذي نشرته أكاديمية العلوم في اتحاد الجمهوريات الاشتراكية السوفياتية (AN SSSR) وتم تحريره بواسطة V.L Komarov و B. K. Shishkin. تم وصف المملكة النباتية لجميع مناطق الأرض تقريبًا في الكتيبات المقابلة ، بشكل أساسي في النباتات الإقليمية. إن دراسة N. في أعماله ، كان فافيلوف أول من قدم صورة لتطور أشكال النباتات المزروعة في عدد قليل من أماكن المنشأ. نتيجة للبعثات التي نظمها ، تم جمع مخزون قيم من الموارد النباتية العالمية. إنه يشكل مجموعة غنية للغاية من النباتات ، والتي يتم الاحتفاظ بها في معهد الاتحاد الأفريقي للبستنة.

حفزت دراسة تصنيف عدد كبير من النباتات من جميع مناطق العالم على تطوير العمل في مجال مورفولوجيا النبات. كان عالم النبات الإنجليزي آر براون ، من أوائل علماء التشكل في القرن التاسع عشر ، الذي أظهر أن عاريات البذور تتميز عن كاسيات البذور ببويضاتها المجردة ، وشرح طبيعة أزهار الحشائش ، وقام بسلسلة أخرى من الأعمال في علم التشكل. واصل براون ورسكووس العمل في علم الأجنة من قبل العالم الإيطالي جي بي أميتشي ، وعالم النبات الفرنسي أ.برونجنيارت ، وخاصة العالم الألماني دبليو هوفمايستر ، الذي وصف عملية الإخصاب في النباتات. استمرت الأعمال الكلاسيكية لهوفمايستر من قبل مواطنه إي.ستراس-برجر والعلماء الروس إي.ن.جوروزانكين ، في آي بيلييف ، وس. كان Gorozhankin أول من أظهر أن نوى أنبوب حبوب اللقاح تخترق البويضة. تنبأ بيلييف بوجود أشباه منوية متحركة في عاريات البذور ، والتي تم اكتشافها بعد فترة وجيزة من قبل علماء النبات اليابانيين S. Hirase في الجنكة و S. Ikeno في نخيل الساغو. بعد عمل عالم الأجنة الروسي س.

بدأ تشريح النبات ، الذي نشأ في القرن السابع عشر ، في التطور بسرعة كبيرة في منتصف القرن التاسع عشر. وترتبط نجاحاته بأسماء عالم النبات الألمان H. Mohl و C. Sanio ، اللذين أعطيا البيانات الأولى عن الهياكل المجهرية لأجسام النباتات العليا. في منتصف القرن التاسع عشر ، كان هناك اتجاهان ملحوظان في تشريح النبات. كان أحدهم مهتمًا بشكل أساسي بمشاكل بنية النباتات ، وموقعها الضريبي ، وتطور الهياكل ، بينما أعطى الآخر مزيدًا من الاهتمام للأهمية الفسيولوجية والبيئية للأنسجة النباتية المختلفة. كان من بين مؤيدي الاتجاه الأول الفرنسيان P.E. van Tieghem و J. Vesque والألماني H. Solereder ، مؤلف الخلاصة التشريح المنهجي للفلقتين (1899). في كتابه تشريح النباتات الخشبية (1917) ، حاول الأمريكي إي جيفري إعطاء صورة عامة لتطور الهياكل التشريحية لجميع النباتات العليا. ابتكر طلابه E. Sinnott و A. Eames وخاصة I. W. Bailey مفهومًا لتطور هياكل النباتات العليا المنسقة جيدًا مع آراء C.E Bessey و H. Hallier و J. Hutchinson. كان من بين علماء التشريح الذين يدعمون الاتجاه الثاني في تشريح النبات عالما النبات الألمان S. Schwendener و G.Haberlandt وعلماء التشريح السوفيتي V.

في نهاية القرن التاسع عشر ، أدت الأعمال في مجال البيئة النباتية والجغرافيا ، وكذلك الاستفسارات المتعلقة بالغابات ودراسة المروج ، إلى تمييز منطقة خاصة من علم النبات تسمى علم النبات أو علم النبات في الاتحاد السوفياتي. تم إنشاء المدرسة الروسية والسوفيتية لعلم النبات من خلال أعمال S. I. Korzhinskii، I.K Pachoski، G. Tanfil & rsquoev ، G. F. Morozov ، V. V. Alekhin ، L.G Ramenskii ، A. P. Shennikov ، وخاصة V.N. Sukachev. أدت الحاجة الماسة للزراعة للسيطرة على مناطق شاسعة من الاتحاد السوفيتي إلى وضع أصبحت فيه مشاكل علم النبات من أكثر الأسئلة حيوية في علم النبات. لهذا السبب ، فإن علماء الجيولوجيا هم القسم الأكثر عددًا من علماء النبات السوفييت.

تم تطوير مدارس علم النبات في أمريكا الشمالية وأوروبا ، التي يمثلها F. Clements و J. Braun-Blanquet و E.R & Uumlbel و A. في الآونة الأخيرة فقط كان هناك أي تقارب في وجهات نظر الباحثين السوفييت وأمريكا الشمالية.

تطور علم الحفريات النباتية ، أو علم الحفريات ، التي يمكن إرجاع أصولها إلى القرن الثامن عشر وعمل ج. شوشزر من سويسرا ، بشكل مطرد في القرنين التاسع عشر والعشرين. في القرن التاسع عشر ، لم تكتف أعمال الباحثين العاملين في جميع القارات بوصف عشرات الآلاف من بقايا النباتات من جميع طبقات الرواسب الرسوبية فحسب ، بل خلقت أيضًا نظامًا منظمًا بشكل كافٍ من النباتات المنقرضة وربطها بأحفادها المعاصرة. تم تقديم مساهمات مهمة في دراسة الحفريات النباتية الموجودة على أراضي الاتحاد السوفياتي من قبل M.D.Zalesskii و I.V Palibin و A.N. Krishtofovich.

خصائص المرحلة الحالية من تطور علم النبات تتميز المرحلة الحالية في تطور علم النبات بطمس الفروق بين الفروع الفردية لعلم النبات واتجاه نحو تكاملها. وهكذا ، في تصنيف النبات ، يتم تطبيق الأساليب الخلوية والتشريحية والجنينية والكيميائية الحيوية بشكل متكرر أكثر فأكثر من أجل تحديد خصائص الأصناف الفردية. تم اعتماد طرق الكيمياء الحيوية وعلم وظائف الأعضاء من قبل علماء البيئة وعلماء النباتات الجيولوجية. ونتيجة لذلك ، نشأ علم معقد لفسيولوجيا المجتمعات النباتية ، وتوقع ظهوره في وقت مبكر من عام 1920 من قبل العالم الروسي V.V. على نحو متزايد ، يتم الاعتراف بضرورة النظر في دور الكائنات الحية الدقيقة مثل الطحالب والفطريات والبكتيريا والفطريات الشعاعية في التحقيقات الجيولوجية والبيئية. يعمل المتخصصون في أنواع المدارس ذات الصلة أكثر فأكثر على اتصال مع علماء الجيولوجيا وعلماء البيئة. هذا يؤدي إلى توسيع مجال عمل علماء الأحياء وعلماء البكتيريا وعلماء الفطريات ، الذين يدرسون الكائنات الحية التي تهمهم في محيطهم الطبيعي.

يتم تطبيق التجريب على نطاق واسع في مجالات علم النبات حيث سادت طريقة المراقبة مرة واحدة. تعمل في مجالات التصنيف التجريبي وعلم النبات على نطاق واسع. بالإضافة إلى التجارب المعتادة ، فإن طريقة زراعة الأنسجة التي يتم فيها عزل الأنسجة من تأثير الكائن الحي ككل تستخدم على نطاق واسع في مورفولوجيا النبات.

لقد سمح تطوير طرق بحث جديدة تعتمد على إنجازات الفيزياء والكيمياء بحل المشكلات التي كانت ذات يوم صعبة للغاية. وهكذا ، نتيجة لاستخدام المجهر الإلكتروني ، الذي تبلغ قوته التحليلية مائة مرة من الأجهزة البصرية الأخرى ، تم اكتشاف العديد من التفاصيل الجديدة لبنية الخلايا النباتية. يمكن استخدام هذه المعلومات بنجاح ليس فقط في علم التشريح ولكن أيضًا في تصنيف النبات. تتيح طرق الفصل اللوني والقياس الضوئي الخلوي ، من بين أمور أخرى ، التحليل الكيميائي للمواضيع المجهرية بسرعة ودقة لم يسمع بها من قبل. هذا ينطبق على جميع مجالات علم النبات تقريبًا. إلى حد ما ، سهلت إنجازات البيولوجيا الجزيئية فصل فسيولوجيا النبات والكيمياء الحيوية النباتية عن علم النبات العام. بالإضافة إلى ذلك ، فإن هذه الإنجازات ، التي ستتيح الاكتشاف المستقبلي للقواعد الجزيئية لنشأة النباتات وتطورها ، قد فتحت آفاقًا جديدة في مجالات تصنيف النبات وتشكل النبات. لا تزال هناك فجوة كبيرة في معرفتنا بالآليات التي تتحكم في الشفرة الجينية الفريدة لجميع خلايا فرد معين (أو حتى الأنواع) وتؤدي إلى اختلاف مذهل بين خلايا الأنسجة المختلفة.

في الوقت نفسه ، تحول انتباه علماء النبات بشكل متزايد نحو المشاكل النباتية لكوكبنا بأكمله. يتم حل مشاكل إنتاجية الرموز الفيزيائية وتأثيرها على ظروف الماء والغاز على كوكب الأرض ومشاكل إعادة تدوير المادة وتوازن الطاقة والمادة على أساس الملاحظات التي تم إجراؤها بدقة عالية ومتقنة بشكل متزايد أدوات مع ضوابط تلقائية. إن التأثير العالمي للإنسان على الطبيعة ، والذي يمارس أحيانًا دون مراعاة دقيقة للعواقب المحتملة ، يجعل عمل علماء النبات مهمًا للغاية لمصير الحضارة.

المؤسسات النباتية الرائدة والمنظمات الدولية والمؤلفات الدورية يتم تحديد تنظيم البحوث النباتية في اتحاد الجمهوريات الاشتراكية السوفياتية من خلال النظام الكامل للمؤسسات النباتية الخاضعة لاختصاص أكاديميات AN SSR للعلوم في اتحادات جمهوريات علم النبات في الجامعات والمؤسسات التربوية والصيدلانية والزراعية للتعليم العالي الحدائق النباتية تحت اختصاص أقسام مختلفة من معاهد البحث العلمي المتخصصة وشبكة المحميات العاملة في جميع أنحاء الاتحاد السوفياتي. المراكز الرائدة للفروع الفردية لعلم النبات هي معاهد AN SSSR: معهد VL Komarov النباتي (لينينغراد) ، ومعهد KA Timiriazev لفيزيولوجيا النبات (موسكو) ، ومعهد AN Bakh للكيمياء الحيوية (موسكو) ، ومعهد علم الوراثة العامة والحدائق النباتية. هناك أيضًا مؤسسات نباتية في فروع AN SSR وأكاديميات العلوم الجمهورية. تتم دراسة العديد من المشكلات النباتية من قبل عدد من المؤسسات في قسم سيبيريا التابع لـ AN SSSR. تتم دراسة النباتات المزروعة في معهد N. I. Vavilov AU-Union للبستنة في لينينغراد وفي العديد من أقسامها وقواعدها.

بالإضافة إلى ذلك ، هناك معاهد متخصصة لدراسة الأعلاف الحيوانية (موسكو) ، والمحاصيل شبه الاستوائية والمزارع الخضراء (أذربيجان) ، ووقاية النبات (لينينغراد) ، وكذلك معهد عموم الاتحاد للبحوث العلمية للنباتات الطبية (موسكو). تم تجهيز المؤسسات النباتية بمختبرات متخصصة ومحطات بحثية وقواعد تجريبية. يوجد أعشاب في بعضها.

علماء النبات السوفييت متحدون في جمعية نباتات عموم الاتحاد وأقسامها العديدة ، وجمعية موسكو لعلماء الطبيعة ، والجمعية الجغرافية لاتحاد الجمهوريات الاشتراكية السوفياتية ، ومنظمات أخرى. في قسم علم الأحياء العام في AN SSSR ، توجد مجالس مشكلة علمية في دراسة النباتات والغطاء النباتي ، وعلم البيئة الحيوية ، وإدخال النباتات وتأقلمها. من بين المجلات المنشورة في اتحاد الجمهوريات الاشتراكية السوفياتية Botanicheskii zhurnal SSSR (منذ عام 1916) ، Fiziologiia rastenii (فسيولوجيا النبات منذ 1954) ، Rastitel & rsquonye resursy (الموارد النباتية منذ عام 1965) ، و Mikologiia i fitopatologiia (منذ 1967). يتم أيضًا نشر العديد من الدراسات والكتب المرجعية والكتيبات والمقالات حول مختلف فروع علم النبات. يشارك علماء النبات السوفييت في أعمال العديد من الجمعيات والمجلات الأجنبية ، فضلاً عن المؤتمرات والندوات والمؤتمرات.


أولاس بيدمال

على عكس الحيوانات ، ليس للنباتات أعضاء محددة ترى أو تسمع المنبهات المختلفة ، ومع ذلك ، فإن النباتات حساسة للبيئة المحيطة بها وتعديل تطورها وفقًا للإشارات الخارجية المختلفة. يدرس مختبري كيف تقوم بيئة النبات بتعديل نموه وتطوره. سيكون لفهم التحكم البيئي للنمو آثار بعيدة المدى على الزراعة وإنتاج الطاقة والعديد من الأنشطة البشرية الأخرى.


ما هو النبات الذي قمت بجمعه؟ - مادة الاحياء

مجموعة عسلي أكملت بنجاح الإصدار الثاني من علم الأحياء النباتية والجزيئية الذي تم تنظيمه خلال الفترة من 23 إلى 25 أكتوبر 2019 في أمستردام ، هولندا. بعد النجاح الباهر الذي حققه برنامج PMB 2019 ، يسعدنا أن نعلن عن المؤتمر الدولي الثالث لعلم الأحياء النباتية والجزيئية (PMB 2021) تم جدولته خلال شهر نوفمبر 23-25, 2021 في براغ ، جمهورية التشيك. مع التركيز بالفعل على التقدم الأساسي للتطورات والتطورات من خلال أحدث الأبحاث والممارسات المسبقة في المصنع.

يتضمن هذا الاجتماع عدة جلسات تفاعلية مصممة خصيصًا للنشاط التعليمي الذي نال استحسانًا كبيرًا والذي تم اعتباره أحد الاجتماعات السائدة حول هذا الموضوع. الهدف من مؤتمر النبات - 2021 هو تعزيز نهج متعدد التخصصات للابتكار والاختراع في أبحاث علوم النبات ، يجب أن تحتوي الملخصات على بيانات بحث أصلية تم جمعها بواسطة المؤلف (المؤلفين). سيتم اختيار العروض التقديمية بناءً على تعبيرها وتصميمها وخصائصها الأخرى ، والتي تغطي جوانب أوسع من أبحاث علوم النبات بالإضافة إلى سياساتها المتعلقة بالمواضيع. تم تعزيز المؤتمر من خلال توفير كلمة رئيسية تفاعلية وورش عمل وجلسات عرض شفوية وملصقات. سيتم تخصيص 30 دقيقة لكل مقدم عرض فردي للتعبير عن خبراته البحثية تليها مناقشة تفاعلية بقيادة السلطات الرائدة.

تهدف اللجنة إلى خلق بيئة شبكة ودية ودافئة بين المشاركين مما يجعل من السهل التفاعل مع الكليات الأخرى / الحاضرين للتواصل مع بعضهم البعض وتبادل أفكارهم وإنشاء الأساس للرؤية المستقبلية والتنمية. نتطلع إلى لقائكم جميعًا في براغ.


المواد والأساليب

ص. ساتيفوم المادة النباتية وظروف النمو

البازلاء (ص. ساتيفوم L.) تم استخدام خط Sprint-2 من مجموعة معهد أبحاث عموم روسيا لعلم الأحياء الدقيقة الزراعية (سانت بطرسبرغ ، روسيا) مع النمو المحدد ، بداية الإزهار المبكر ، ونضج البذور المبكر [92،93]. للحصول على البذور في مراحل مختلفة من النضج ، زرعت بذور البازلاء في أصص مع تربة الخث "Terra vita Universal" (MNPP FART ، روسيا) بالخصائص التالية: الأس الهيدروجيني (KCl) 6.0 150 مجم / لتر من النيتروجين المتاح (NH4 + + لا3 -) 270 مجم / لتر من الفوسفور المتاح (P.2ا5) و 300 مجم / لتر من البوتاسيوم المتاح (K.2س). نمت النباتات في غرفة بيئة ثابتة (نموذج VB 1514 ، Vötsch ، ألمانيا) عند 16/8 ساعة و 24/22 درجة مئوية في نظام النهار / الليل ، والرطوبة النسبية 75 ٪ ، وحوالي 10000 لوكس الإضاءة. تم اعتبار تاريخ الفتح الكامل للزهرة تاريخ التلقيح. تم جمع البذور المعدة لعزل أجزاء البروتين المقاومة للمنظفات بعد 10 و 20 و 30 يومًا من التلقيح ، والتي تتوافق مع المراحل التالية من نضج البذور: (1) القرون المسطحة ، (2) ملء القرون (البذور الخضراء) ، و ( ج) جراب أصفر متجعد [94]. تم ترك العديد من النباتات المزروعة حتى مرحلة الحصاد الجاف [94] من أجل دراسة تأثير الإنبات على محتوى البذور المقاومة للمنظفات بعد ذلك. تم تطهير سطح بذور البازلاء الجافة المحصودة لمدة 6 دقائق في حمض الكبريتيك بنسبة 98٪ ، ثم شطفها جيدًا بالماء المعقم ووضعها على أطباق بتري تحتوي على 1٪ أجار أجار معقم. بعد إنبات البذور لمدة 3 أيام عند 27 درجة مئوية ، تم اختيار الشتلات الداكنة بدون علامات التلوث الجرثومي وتم قطع فلقاتها. تم تجميد بذور النباتات والنباتات التي تم جمعها على الفور في نيتروجين سائل ثم تخزينها عند -80 درجة مئوية.

السلالات الميكروبية والبلازميدات وظروف الزراعة

تنصهر البلازميدات لتحليل تراكم Vicilin و Cupin-1.1 و Cupin-1.2 مع YFP في الخميرة س. الخباز تم الحصول عليها عن طريق إدخال شظايا تضخيم PCR من الجينات المقابلة تضخيمها باستخدام أزواج التمهيدي التي تحتوي على إدخال باممرحبًا (عكسي) و هندمواقع التقييد III (إلى الأمام) (جدول S3) وجزء بذور البازلاء (كدنا) كقالب في بلازميد pRS315-CUP1-SIS1-YFP [95] بواسطة باممرحبا و هندالمواقع الثالثة ، على التوالي. تم استخراج إجمالي الحمض النووي الريبي من بذور البازلاء باستخدام Trizol (Invitrogen ، Carlsbad ، CA) وتم تحضير cDNA باستخدام النسخ العكسي SuperScript III (Invitrogen ، Carlsbad ، CA). ه. القولونية تم استخدام سلالة DH5α [96] لتضخيم البلازميد. تم تأكيد إدخال الجينات المقابلة عن طريق التسلسل باستخدام التمهيدي CUP1 [95].

ال س. الخباز 1-OT56 سلالة (حصيرةأ ade1-14UGA له 3 ليو 2 trp1-289UAG ura3 [رطل - ][دبوس +]) [97] تم تحويله بالبلازميدات المركبة. تم إجراء زراعة الخميرة على وسائط أجار انتقائية عند 30 درجة مئوية لمدة 4 أيام متبوعة باستبدال وسائط أجار بـ 150 ميكرولتر مل من CuSO4 ل كوب 1 تحريض المروج. تم تحليل الإسفار باستخدام مجهر فلورسنت Zeiss Axio Imager A2 (Carl Zeiss ، ألمانيا).

لإنشاء بلازميدات لتصدير Vicilin و Cupin-1.1 و Cupin-1.2 بواسطة نظام C-DAG ، تم تضخيم الأجزاء المهمة بواسطة PCR باستخدام أزواج من البادئات المحاطة بـ لا1 (إلى الأمام) و سال1 مواقع التقييد (العكسي) (جدول S3) وبذور البازلاء (كدنا) كقالب. تم هضم منتجات PCR وناقل pExport [57] بواسطة لا1 و سال1 إنزيمات التقييد ثم ربطها. تم إنشاء البلازميدات المشفرة للخميرة Sup35NM (aa 2-253) و Sup35M (aa 125-253) المدمجة مع تسلسل إشارة CsgA سابقًا [57].

فحص C-DAG

تم إجراء تحليل لخصائص الأميلويد لـ Vicilin و Cupin-1.1 و Cupin-1.2 باستخدام نظام C-DAG كما هو موضح سابقًا [57]. لتصدير البروتينات على سطح الخلية ه. القولونية تم تحويل السلالة VS39 [57] باستخدام البلازميدات القائمة على pExport ، حيث تم دمج Vicilin و Cupin-1.1 و Cupin-1.2 مع تسلسل إشارة CsgA. تم استخدام تصدير البروتينات Sup35NM المكونة للأميلويد وبروتينات Sup35M غير النشواني المنشأ كعنصر تحكم إيجابي وسلبي في تكوين الأميلويد ، على التوالي. تم إجراء تحليل الانكسار باستخدام مجهر الضوء المرسل Axio Imager A2 (كارل زايس ، ألمانيا) المجهز بموضع 40 × ومستقطب عرضي. لتحليل TEM تم استخدام حضانة على لوحات تحريض بدون صبغة CR.

خطوط خلايا الثدييات ومقايسة السمية

تم بذر خلايا DLD1 البشرية عند 5 × 10 4 خلايا لكل كثافة بئر على 24 لوحًا جيدًا وتعريضها لعينات بروتينية تم تحليلها. في النقاط الزمنية المحددة ، تم استبدال الوسط بمحلول 0.5 مجم / مل MTT لمدة ساعة واحدة عند 37 درجة مئوية. ثم تم إذابة فورمازان في DMSO ، وتم قياس الكثافة الضوئية بطول موجة 572 نانومتر باستخدام مقياس الطيف الضوئي Multiscan Ex (Thermo Fisher Scientific ، Waltham ، MA). تم تقديم البيانات على أنها متوسط ​​3 تجارب مستقلة - الخطأ المعياري للمتوسط.

المقايسة البروتينية PSIA-LC-MALDI

تم نشر الاختبار البروتيني PSIA-LC-MALDI لتحديد معقدات البروتين المقاومة للعلاج بالمنظفات الأيونية سابقًا [27]. هنا ، استخدمنا هذا البروتوكول مع العديد من التعديلات. تم تعطيل فلقات بذور البازلاء المجمدة (1 جم) بالمدقة والملاط في النيتروجين السائل. تم إذابة المسحوق الناتج في 5 مل من محلول PBS و تمت معالجته بـ 1٪ SDS و 0.2٪ منظفات Tween-20 لمدة 15 دقيقة. بعد ذلك ، تم ترسيب lysate عند 10000 جم لمدة 5 دقائق تم نقل المادة الطافية إلى أنبوب جديد وترسب مرة أخرى. تم تحميل المادة الطافية الناتجة على الجزء العلوي من 1.5 مل من 25 ٪ سكروز / PBS مع وسادة SDS بنسبة 0.1 ٪ وطرد مركزيًا لمدة 8 ساعات ، 225000ز عند 18 درجة مئوية في جهاز الطرد المركزي فائق السرعة L8-70 (بيكمان كولتر ، بري ، كاليفورنيا) ، دوار من النوع 50 Ti (بيكمان كولتر ، بريا ، كاليفورنيا). تم غسل الكريات الناتجة في 5 مل من الماء المقطر وطردها مرة أخرى (1.5 ساعة ، 225000ز، 4 درجات مئوية ، نابذة فائقة السرعة L8-70 (بيكمان كولتر ، بري ، كاليفورنيا) ، دوار بزاوية من النوع 50 Ti (بيكمان كولتر ، بريا ، كاليفورنيا). وتكرر هذه الخطوة مرتين.

بعد ذلك ، تم تجميد العينات بالتجميد ومعالجتها بحمض الفورميك لإذابة البروتينات وتجفيفها مرة أخرى. تمت إزالة الأملاح والمنظفات ، وتم إخضاع العينات لمرحلة تحلل التربسين متبوعة بالكروماتوجرافيا السائلة عالية الأداء للطور العكسي وقياس الطيف الكتلي كما هو موضح سابقًا [27]. أثناء التحليل ، تم استخدام معلمات محددة مسبقًا لـ "تحمل الكتلة" (تحمل كتلة السلائف 50 جزء في المليون ، تحمل كتلة الشظايا 0.9 دا). تم تطبيق معيار معايرة الببتيد II 8222570 (Bruker Daltonics ، Billerica ، MA) كعينة قياسية. تم اعتبار كاربوكسي ميثيل السيستين ، والأكسدة الجزئية للميثيونين ، وتخطي موقع واحد لتحلل التربسين من التعديلات المسموح بها. تمت مطابقة أطياف الكتلة التي تم الحصول عليها مع البروتينات المقابلة باستخدام قاعدة بيانات NCBI. تم استخدام برنامج BioTools (Bruker Daltonics ، Billerica ، MA) للتحقق اليدوي من تحديد البروتين.

تعبير البروتين وتنقيته

للتعبير عن Vicilin ، و Cupin-1.1 ، و Cupin-1.2 C- منصهرًا نهائيًا بعلامة 6x-His ، تم استخدام مجموعة Alicator (Thermo Fisher Scientific ، Waltham ، MA). تم تضخيم شظايا PCR باستخدام أزواج التمهيدي الخاصة بها (جدول S3) وبذور البازلاء (كدنا) كقالب. تم إدخال الأجزاء التي تم تضخيمها بواسطة تفاعل البوليميراز المتسلسل في ناقل pAlicator (Thermo Fisher Scientific ، Waltham ، MA) وفقًا لتوصيات الشركة الصانعة. تم التحقق من صحة البلازميدات الناتجة عن pAc-Vicilin و pAc-Cupin-1.1 و pAc-Cupin-1.2 من خلال التسلسل باستخدام البادئات المقدمة من الشركة المصنعة (Thermo Fisher Scientific ، Waltham ، MA).

لتعبير البروتين ، ه. القولونية تم استخدام سلالة BL21 (New England Biolabs ، Ipswich ، MA). تم إجراء الإنتاج الزائد للبروتينات المؤتلفة في وسط 2TYa مكمل بـ 0.1 ملي مولار IPTG. نمت الثقافات عند 37 درجة مئوية لمدة 4 ساعات. تمت تنقية البروتينات في ظروف تغيير طبيعة (في وجود 8 ميكرولتر من اليوريا) وفقًا لبروتوكول منشور سابقًا [98] بدون خطوة تنقية Q-sepharose. تم إجراء عملية تنقية من خطوة واحدة باستخدام عمود Ni-NTA agarose (Invitrogen ، Carlsbad ، CA) وفقًا لتوصيات الشركة المصنعة. تم تركيز البروتينات باستخدام الإيثانول بدلاً من الميثانول المستخدم في البروتوكول الأصلي.

الرجفان البروتيني في المختبر

لبدء استخدام Vicilin وتجميع مجالاته في المختبر ، تم استخدام محاليل وظروف حضانة مختلفة. في المرحلة الأولى ، تم تحضين البروتينات بتركيز 0.5 مجم / مل في محلول فوسفات البوتاسيوم 5 ملي مولار [7.4] عند درجة حرارة الغرفة وعند 50 درجة مئوية مع التقليب المستمر لمدة أسبوعين. علاوة على ذلك ، تمت إذابة البروتينات الموجودة في نفس التركيز في 50٪ HFIP (Sigma-Aldrich ، و St. Louis ، و MO) وحضنت لمدة 7 أيام. بعد ذلك ، تم تبخير HFIP ببطء تحت تيار من النيتروجين إلى ثلث إلى ربع حجم العينة ثم تم تعديل حجم العينة بالماء المقطر إلى الحجم الأولي ، وتم تقليب العينات لمدة 7 أيام إضافية. يستخدم هذا المذيب (غالبًا 100٪ HFIP) على نطاق واسع لضمان أن البروتينات والببتيدات أحادية بالكامل قبل بدء تجارب التجميع التناظرية. علاوة على ذلك ، تم تطوير طريقة سابقًا للتحضير المعياري والمتوافق حيوياً لـ Aβ الخالي من الركام للدراسات الفيزيائية الحيوية والبيولوجية لمرض الزهايمر [99] ، أحد مراحلها هو تفكك الببتيد في HFIP. بالنظر إلى حقيقة أن Vicilin ، و Cupin-1.1 ، و Cupin-1.2 ضعيفة الذوبان في المحاليل المنظمة العادية ، فإننا نقترح أن استخدام HFIP مع إزالته اللاحقة من العينة بعد إذابة البروتين (أي أن تكون الليف يحدث في الماء المقطر ، وليس في HFIP) هو أخف التأثيرات المحتملة التي تؤثر بشكل طفيف على بنية وخصائص البروتين. تم استخدام هذه الظروف أيضًا لإجراء تجارب على البذر. تم تحضير "البذور" على أساس خليط Vicilin الذي تم الحصول عليه سابقًا من الركام الليفي وغير الليفي ، ليفي Cupin-1.1 وليفات Cupin-1.2. تمت إضافة هذه البذور إلى العينات في بداية التكوُّن الليفي بتركيز 1٪ (حجم / حجم).

استخراج بروتين بذور البازلاء ، في فصل الهلام ونقله

تم استخدام بروتوكول قياسي لعزل البروتين الكلي من بذور البازلاء. تم جمع ثلاث بذور جمعت في مرحلة النضج المحددة أو فلقات من 3 بذور بعد الإنبات تم تحليلها في كل عينة. البازلاء المعلبة التي تنتجها Bonduelle (مجموعة Bonduelle ، فرنسا) و Heinz (H.J. Heinz ، Pittsburgh ، PA) تم شراؤها في سوبر ماركت في سانت بطرسبرغ ، روسيا. تم إجراء تجانس البذور باستخدام الخرز الزجاجي. تمت معايرة تراكيز البروتين باستخدام مقياس التألق Qubit 3 (Invitrogen، Carlsbad، CA). ثم تمت إضافة المنظفات بالتتابع إلى التركيزات النهائية: 0.5 ٪ توين 20 (هيليكون ، روسيا) ، 0.5 ٪ SDS (هيليكون ، روسيا) متبوعة بحضانة لمدة 10 دقائق في RT. علاوة على ذلك ، إذا لزم الأمر ، تم تطبيق مقايسة IVPD. بعد ذلك ، تم غلي العينات في وجود 2 ٪ SDS لمدة 5 دقائق وتحميلها على هلام SDS-PAGE 10 ٪ (Bio-Rad ، Hercules ، CA). بعد SDS-PAGE ، تم إجراء النقل الرطب (Bio-Rad ، Hercules ، CA) باستخدام غشاء PVDF (GE Healthcare ، Chicago ، IL).

تم هضم بروتينات بذور البازلاء في المختبر كما هو موصوف سابقًا [59]. بعد كل خطوة من خطوات المعالجة بالإنزيم ، تم جمع العينات وتعطيلها بالتسخين عند 100 درجة مئوية لمدة 5 دقائق. تم استخدام البيبسين (روش ، ألمانيا) والبنكرياس من بنكرياس الخنازير (سيجما الدريتش ، سانت لويس ، مو). تم فحص العينات باستخدام SDS-PAGE تليها لطخة غربية مع الأجسام المضادة متعددة النسيلة المضادة للفيسيلين (Imtek ، روسيا). تم إجراء جميع التحليلات في أربع مرات.

التحليل المناعي الكيميائي

للحصول على الأجسام المضادة متعددة النسيلة المضادة لـ Vicilin من مصل أرنب سليم ، تم إجراء التحصين مع مستضد Vicilin المؤتلف كامل الطول الذي تم الحصول عليه وفقًا للبروتوكول الموصوف أعلاه (بدون خطوة الرجفان). تم إجراء تحصين الأرانب وتنقيتها باستخدام كروماتوجرافيا التقارب مع مضاد الأرانب على مادة ماصة مع بروتين Vicilin المؤتلف الثابت في شركة Imtek (Imtek ، روسيا). تم فحص الجسم المضاد للتعرف على Vicilin كامل الطول ومجالاته ، Cupin-1.1 و Cupin-1.2 ، ولغياب التفاعل المتبادل مع ه. القولونية البروتينات (S8 الشكل). تم استخدام التخفيف 1: 1،000. تم استخدام المزيد من الأجسام المضادة IgG (H + L) المضادة للأرانب من الماعز (Thermo Fisher Scientific ، Waltham ، MA) في التخفيف 1: 33000. أيضًا ، تم استخدام الجسم المضاد لعلامة حلقية 6x (4A12E4 ، Invitrogen ، Carlsbad ، CA) في التخفيف 1: 5000 ثم تم استخدام الجسم المضاد الثانوي IgG (H + L) الماعز (Invitrogen ، Carlsbad ، CA) في التخفيف 1: 5000.

عزل جسم البروتين

تم استخراج PB من بذور البازلاء الطازجة لمدة 30 يومًا بعد التلقيح وفقًا للبروتوكول المعدل لـ زيا ميس PB [100]. على وجه الخصوص ، تم طحن 0.5 جم من البذور بقذائف هاون ومدقة مبردة في وجود 5 مل من 10٪ (وزن / وزن) سكروز في برنامج تلفزيوني يحتوي على 1 ملي مولار من فلوريد فينيل ميثيل سلفونيل. تم ترشيح المتجانسة الناتجة من خلال قماش النايلون ثم طرد المرشح عند 500ز و 4 درجات مئوية لمدة 10 دقائق. تم وضع المادة الطافية على تدرج سكروز متقطع يتكون من 1 و 1.5 و 1.5 مل من وسائد سكروز 70٪ و 50٪ و 20٪ (وزن / وزن) في برنامج تلفزيوني ، على التوالي ، في أنبوب البولي كربونات السميك المفتوح (Beckman Coulter ، Brea ، CA) والطرد المركزي في جهاز الطرد المركزي الفائق L8-70 (Beckman Coulter ، Brea ، CA) في الدوار بزاوية Type50 Ti (Beckman Coulter ، Brea ، CA) عند 36500ز و 4 درجات مئوية لمدة ساعة واحدة. تم جمع PB من حد 70٪ و 50٪ وسائد كجزء من هالة بيضاء معتمة. تم استخراج ما يقرب من 100 ميكرولتر من هذا الجزء ، وتم تخفيفه بمقدار 10 أضعاف باستخدام برنامج تلفزيوني ، وطرده عند 12000.ز، 4 درجات مئوية، 5 دقائق. تم التخلص من المادة الطافية وتم تعليق الحبيبات في 10 ٪ سكروز في برنامج تلفزيوني.

التهجين في الموقع والفحص المجهري الفلوري

تحضير الشرائح: تم لصق بذور البازلاء الناضجة بحامل Tissue-Tek O.C.T.مركب (ساكورا فينيتيك ، اليابان) ومقطع باستخدام ناظم ناظم CM3050 S (لايكا بيوسيستمز ، ألمانيا) عند -16 درجة مئوية إلى 20 ميكرومتر ، والتي تم تركيبها على شرائح مطلية بالبولي-إل-ليسين. لتعزيز التصاق أفضل ، تم الاحتفاظ بالشرائح لمدة 12 ساعة على الأقل عند 37 درجة مئوية. تحضير PB: تم تطبيق محلول السكروز من PB على شرائح مغلفة بالبولي- l- ليسين وتجفيفه بالهواء لمدة 30 دقيقة عند درجة حرارة الغرفة. تم غسل الشرائح مرتين لمدة 5 دقائق في محلول ملحي مخزّن من تريس (TBS ، 0.1 م) ، تم حظره لمدة ساعتين في غرفة رطبة عند درجة حرارة الغرفة مع محلول يحتوي على 10 ٪ من مصل الماعز الطبيعي (Sigma-Aldrich ، St. ٪ Triton X-100 (Sigma-Aldrich، St. Louis، MO) على TBS. تم تحضين المقاطع بالأجسام المضادة الأولية في غرفة رطبة عند 4 درجات مئوية طوال الليل. تم تطبيق الأجسام المضادة متعددة النسيلة للأرانب المضادة لـ Vicilin بتركيز 1: 100 في TBS مع 0.01 ٪ Triton X-100 و 1 ٪ من مصل الماعز الطبيعي. تم الكشف عن الأجسام المضادة الأولية عن طريق الحضانة لمدة ساعتين عند 37 درجة مئوية بمحلول الأجسام المضادة الثانوية: الماعز المضاد للأرانب IgG ، مترافق مع Alexa Fluor 568 (Thermo Fisher Scientific ، Waltham ، MA) المخفف 1: 250 في TBS يحتوي على 1 ٪ من مصل الماعز الطبيعي و 0.01٪ تريتون X-100. تم غسل المقاطع مرتين باستخدام TBS. تم تلوين الشرائح أيضًا لمدة 40 دقيقة بمحلول 0.5 ٪ من THT (Sigma-Aldrich ، St. تم تجنب أوقات تلطيخ أطول بسبب الغسل السريع لملصق الفلورسنت المناعي. تم إجراء التحكم في تلطيخ غير محدد عن طريق استبدال الجسم المضاد الأولي المنتج في الأرانب بمصل أرنب طبيعي بنسبة 10 ٪. تم تحليل المقاطع باستخدام مجهر مضان Leica DM5500 ومسح مجهر متحد البؤر Leica TCS SP5 (Leica Biosystems ، ألمانيا).

تم الحصول على صور مجهرية باستخدام المجهر الإلكتروني النافذ Libra 120 (كارل زايس ، ألمانيا). تم وضع العينات على شبكات من النيكل مغلفة بأفلام فور فارما (Electron Microscopy Sciences، Hatfield، PA). للحصول على صورة مجهرية إلكترونية ، تم استخدام طريقة التلوين السلبي بمحلول مائي 1٪ من خلات اليورانيل. تم إجراء الفحص المجهري الإلكتروني المناعي كما هو موضح سابقًا [34]. تم استخدام الجسم المضاد المضاد لـ Vicilin متعدد الأضلاع للأرنب عند التخفيف 1:50 والجسم المضاد IgG الثانوي المضاد للأرنب الماعز المترافق مع جزيئات الذهب (Electron Microscopy Sciences ، Hatfield ، PA) عند التخفيف 1:40.

تم تجفيف أجسام البروتين المعزولة على أغطية عند درجة حرارة الغرفة. تم تثبيت Coverslips على بذرة دائرية بشريط موصل على الوجهين لضمان اتصال كهربائي جيد بعد الطلاء. تم طلاء المستحضرات بالبلاتين بسمك 25 نانومتر مع طلاء لايكا EM SCD500 (Leica Biosystems ، ألمانيا) وتم فحصها باستخدام مجهر Tescan MIRA3 LMU (Tescan ، جمهورية التشيك) ​​بإمكانية تسريع تبلغ 9 كيلو فولت باستخدام كاشف SE داخل الحزمة.

الفحص المجهري للاستقطاب

تم إجراء تلطيخ CR لعينات الأميلويد باستخدام محلول CR المشبع (Sigma-Aldrich ، St. Louis ، MO) المرشح من خلال مرشح 45 ميكرون (Merck Millipore ، Burlington ، MA). تم تجفيف العينات الملطخة بـ CR بالهواء وغسلها جيدًا بالماء المقطر. تم تحليل الانكسار باستخدام مجهر الاستقطاب Zeiss Axio Imager A2 (Carl Zeiss ، ألمانيا) المجهز بمستقطبات عرضية.

تلطيخ ThT والفحص المجهري (كنفوكل)

تم استخدام ThT UltraPure Grade (AnaSpec ، Fremont ، CA) بدون تنقية لاحقة. تم تحضير المحاليل المختبرة ليفية ThT عن طريق الغسيل الدقيق للتوازن باستخدام جهاز Harvard / Amika (Harvard Apparatus، Holliston، MA). تم إجراء التحليل الدقيق للتوازن بتركيز من الركام حوالي 0.5 مجم / مل وتركيز أولي من ThT حوالي 32 ميكرومتر. سمحت لنا الدراسة الطيفية للعينة والحلول المرجعية التي أعدتها الطريقة المقترحة بتحديد الخصائص الفيزيائية الضوئية لـ ThT المرتبطة بالأميلويد المختبرة [36].

للحصول على صور مضان لمجهر المسح الضوئي بالليزر المتحد البؤر الملون ThT تم استخدام أوليمبوس FV 3000 (أوليمبوس ، اليابان). استخدمنا هدف الغمر بالزيت بتكبير 60 × وفتحة عددية NA 1.42 والليزر بخط الإثارة 405 نانومتر.

القياسات الطيفية

تم تسجيل أطياف الامتصاص للعينات باستخدام مقياس الطيف الضوئي U-3900H (هيتاشي ، اليابان). تم تحليل أطياف امتصاص البروتينات المتجمعة و ThT في وجودها جنبًا إلى جنب مع تشتت الضوء باستخدام إجراء قياسي [101]. تم تحديد تركيزات Vicilin و Cupin-1.1 و Cupin-1.2 و ThT في المحاليل باستخدام معاملات الانقراض المولي لـ ε280 = 47271 م -1 سم -1 ، ε280 = 16928 م -1 سم -1 ، ε280 = 18.549 م -1 سم -1 ، و ε412 = 31.589 م -1 سم -1 ، على التوالي.

تم قياس أطياف الإثارة الفلورية والفلورية باستخدام مقياس طيفي Cary Eclipse (فاريان ، أستراليا). تم تحمس مضان تى اتش تى بطول موجة 440 نانومتر وسجل عند 490 نانومتر. تم أخذ محلول PBS لـ ATTO-425 ، الذي تشبه أطيافه الفلورية والامتصاص تلك الخاصة بـ ThT ، كمرجع لتحديد العائد الكمي للوميض لـ ThT المرتبط بالألياف. تم أخذ العائد الكمي الفلوري لـ ATTO-425 على أنه 0.9 (كتالوج ATTO-TEC 2009/2010 ص 14). كان عرض الشقوق الطيفية 5 نانومتر في معظم التجارب. لم يؤثر تغيير عرض الشق على نتائج التجربة. تم تصحيح شدة التألق المسجلة على تأثير المرشح الداخلي الأساسي باستخدام الطريقة الموضوعة مسبقًا [37].

تم قياس أطياف القرص المضغوط في منطقة الأشعة فوق البنفسجية البعيدة باستخدام مقياس طيفي J-810 (جاسكو ، اليابان). تم تسجيل الأطياف في خلية بحجم 0.1 سم من 260 إلى 200 نانومتر. لجميع الأطياف ، تم الحصول على متوسط ​​3 عمليات مسح. تم تسجيل طيف القرص المضغوط للمخزن المؤقت المناسب وطرحه من أطياف العينات. لقد اتضح أن أطياف CD المسجلة لمجموعات البروتينات لها تشوه واضح في المنطقة من 250 إلى 260 نانومتر (الشكل 2 أ ، اللوحة اليمنى). وفقًا للأدبيات ، يمكن أن يؤدي تشتت الضوء للجزيئات الكبيرة إلى تشويه أطياف القرص المضغوط إلى حد كبير (انظر ، على سبيل المثال ، عمل Tinoco و Bustamante و Maestre [102]). في الواقع ، تبين أن تشتت الضوء للأميلويد المحضرة مرتفع جدًا مقارنة بمونومرات البروتين (الشكل 2 أ ، أقحم). لقد حاولنا إجراء تحليل كمي للهيكل الثانوي بواسطة برنامج CDPro باستخدام 3 طرق انحدار مختلفة (Selcon و Contin و CDSSTR) والعديد من المجموعات الأساسية من البروتينات ذات البنية الثانوية المعروفة (تشمل المجموعات 37 إلى 56 قابلة للذوبان والغشاء و البروتينات المشوهة بمحتوى مختلف من البنية الثانوية). نظرًا لأن مثل هذه النتائج يمكن أن تكون عشوائية لأن المجموعات الأساسية القياسية من البروتينات المستخدمة لتقدير محتوى البنية الثانوية ليست ممثلة لتحليل أطياف مجاميع البروتين ، فقد أجرينا أيضًا تحليلًا مرئيًا للأطياف المسجلة باستخدام القرص المضغوط أطياف البروتينات والببتيدات ذات الهياكل الثانوية التمثيلية [39].

قياسات مضان تحسم الوقت

تم تسجيل منحنيات تسوس الأسفار بواسطة مطياف FluoTime 300 (PicoQuant ، ألمانيا) باستخدام رأس الصمام الثنائي بالليزر LDH-C-440 (λالسابق = 440 نانومتر). تم تسجيل مضان تى اتش تى فى λم = 490 نانومتر. باستخدام مضان الاضمحلال المسجل تم حساب عمر مضان من تى اتش تى المرتبط بالتجمعات المدروسة. لهذا ، كانت انحلالات الانبعاث المقاسة مناسبة لوظيفة متعددة الأوجه باستخدام إجراء المربعات الصغرى غير الخطية الملتفة والمقارنة المعيارية [103]. في هذه الطريقة ، تمت مقارنة التفاف الدالة الأسية للنموذج مع وظيفة استجابة الأداة بالبيانات التجريبية حتى يتم الحصول على ملاءمة مرضية. استند روتين التركيب على طريقة المربعات الصغرى غير الخطية. تم إجراء التصغير وفقًا لـ Marquardt [104].

تحليل حيود الأشعة السينية

تم تحضير ليفات Vicilin و Cupin-1.1 و Cupin-1.2 كاملة الطول لتحليل حيود الأشعة السينية في المختبر باستخدام تذويب البروتين في 50 ٪ HFIP متبوعًا بتبخير HFIP وحضانة البروتين لمدة 7 أيام في الماء المقطر. للحصول على ليفية Vicilin ، تم استخدام التلقيح ببذور Vicilin مسبقة التشكيل (1/100). تم إجراء غسيل إضافي للألياف التي تم الحصول عليها باستخدام غسيل الكلى المتوازن. تم وضع العينات في أنابيب غسيل الكلى (Scienova ، ألمانيا) بحجم مسام من 12 إلى 14 كيلو دالتون في حاويات تحتوي على ماء منزوع الأيونات مصفى في عينة النسبة / الماء = 1/500 (ت / ت). تم تغيير الماء بعد ساعتين ، ثم بعد 3 ساعات ، وأخيراً بعد ليلة من حضانة العينات. تم الانتهاء من غسيل الكلى بعد يوم واحد من بدء الحضانة. تم تجميد الألياف Vicilin و Cupin-1.1 و Cupin-1.2 (2 مل من محلول 1 مجم / مل) باستخدام مجفف بالتجميد FreeZone 1L (Labconco ، Kansas City ، MO). تم إذابة العينات المجففة بالتجميد (2 مجم) في 20 ميكرولتر من ماء miliQ (حتى التركيز النهائي حوالي 100 مجم / مل). تم وضع قطرات من هذه المستحضرات بين نهايات شعيرات زجاجية مغلفة بالشمع (قطرها حوالي 1 مم) مفصولة بنحو 1.5 مم. تم جمع صور حيود الألياف لـ Cupin-1.1 باستخدام مولد الأشعة السينية Bruker AXS X8 Microstar مع بصريات HELIOX المجهزة بكاشف Bruker AXS Platinum135 CCD (Bruker AXS ، Madison ، WI). تم استخدام إشعاع Cu Kα ، λ = 1.54 Å (1 Å = 0.1 نانومتر). تم وضع العينات في الزاوية اليمنى لحزمة الأشعة السينية باستخدام مقياس زوايا كابا رباعي المحاور. تم جمع صور الحيود لألياف Vicilin و Cupin-1.2 على أداة Rigaku XtaLab Synergy S (Rigaku ، اليابان) مع كاشف HyPix وأنبوب الأشعة السينية من PhotonJet باستخدام إشعاع Cu Kα (1.54184 Å). تم تحضير الصور باستخدام أداة مسحوق الطاقة في حزمة تقليل البيانات CrysAlisPro. تم إجراء التجارب مع دوران 360 درجة ووقت التعرض 300 ثانية.

تنبؤات المعلومات الحيوية لخصائص البروتين

تم حساب الخصائص الفيزيائية والكيميائية لـ Cupin-1.1 و Cupin-1.2 باستخدام برنامج pepstats من حزمة EMBOSS [28]. تم إجراء مقارنة بين تسلسل الأحماض الأمينية لنطاقات Cupin باستخدام محاذاة Smith-Waterman مع برنامج الماء من حزمة EMBOSS [28،29]. تم التنبؤ بالبنية الأحادية لـ Vicilin بواسطة خادم I-TASSER [30]. تم التنبؤ بالمناطق التي يُحتمل أن تكون ناتجة عن الأميلويد باستخدام طريقة AmylPred2 [31] و AmyloidMutants [32].

تحليل البيانات

تم إجراء جميع التجارب في هذا العمل في 3 مكررات على الأقل. يتم تقديم البيانات في الأشكال على أنها المتوسط ​​± الخطأ المعياري للمتوسط ​​أو ± الانحراف المعياري. في مقايسة سمية الخلايا البشرية ، اعتبر اعتماد السمية على التركيز هامًا إذا كان ص- كانت قيمة معامل الانحدار في النموذج الخطي المعمم (دالة glm في لغة R) أقل من 0.05 وبالتالي كان معامل الانحدار مختلفًا بشكل كبير عن الصفر.


ما هو النبات الذي قمت بجمعه؟ - مادة الاحياء

قاعدة بيانات PNRD (قاعدة بيانات RNA النباتية غير المشفرة) هي الإصدار المحدث من PMRD. الحمض النووي الريبي غير المشفر (ncRNA) هو جزيء RNA وظيفي لا يترجم إلى بروتين ، وهو متوفر بكثرة ومهم وظيفيًا. نظرًا لاستخدام PMRD على نطاق واسع كأداة مهمة لدراسة microRNA (miRNA) ، فإننا نعتبر أنه من الضروري تجديد بياناتنا الأساسية ودمج أكبر عدد ممكن من أنواع RNA لمساعدة علماء الأحياء في أبحاثهم في عالم RNA!

تركز قاعدة البيانات الخاصة بنا بشكل أساسي على الأنواع النباتية. بالإضافة إلى زيادة عدد الجزيئات الدقيقة والأنواع مقارنة بالإصدار الأقدم ، قمنا بإجراء العديد من التحسينات. قمنا بجمع 25739 من سجلات RNA غير المشفرة في قاعدة بياناتنا ، بما في ذلك lncRNAs و tRNA و rRNA و tasiRNA و snRNA و snoRNA وما إلى ذلك. لقد قدمنا ​​العديد من أدوات البحث والتحليل الوظيفية: البحث عن الكلمات الرئيسية لـ ncRNA ، والبحث عن الوظائف المستند إلى الأدبيات ، و miRNA-target البحث والتحليل عبر الإنترنت بما في ذلك مجموعة أدوات التنبؤ ميرنا الجديدة ومجموعة أدوات الحاسبة المحتملة للترميز وأداة الانفجار ومتصفح جينوم UCSC المخصص. نعتقد أن PNRD عبارة عن منصة تحليل شاملة لأبحاث ncRNA النباتية.

لقد قمنا بتحديث معلومات 2534 ncRNAs في قاعدة بياناتنا ووصلت الإدخالات في PNRD إلى 28214 الآن. عدد الأنواع 166 نوعًا منها 16 نوعًا نباتيًا جديدًا. لمزيد من المعلومات يرجى النقر هنا. (2016-5-2)

المخطوطة مقبولة من قبل NAR ، ابتهاج! (2014/10/31)

وقد وصلت المدخلات في PNRD إلى 25737 ، تدعم 150 نوعًا من النباتات. تتكون قاعدة البيانات من خمس وحدات وظيفية رئيسية: "بحث" و "تصفح" و "أدوات" و "تنزيل" و "مساعدة". (2014/10/8)

تتوفر صفحة التنزيل وصفحة التعليمات. (2014-08-10)

يتم تحديث بيانات miRNA على PNRD بالإشارة إلى إصدار miRBase 21. (2014/07/15)

تم تصميم قسم الأدوات لدمج عدة أدوات مفيدة. (2014/07/09)

تم تصميم قسم التصفح لتصفح ncRNAs في قاعدة بيانات PNRD. (2014/06/02)

تم تصميم قسم البحث للبحث عن ncRNAs متعدد الوظائف. (2014/05/17)

لقد جمعنا 23313 سجلاً لمختلف أنواع الحمض النووي الريبي غير المشفر. (2014/04/05)

لقد قمنا ببناء النموذج الأولي لـ PNRD. (2014/03/12)

إذا كان لديك أي أسئلة أو تعليقات أو اقتراحات حول موقعنا ، فلا تتردد في الاتصال بنا: [email protected] و [email protected] نحن متعصبون للمعلوماتية الحيوية ونركز على المجتمع الزراعي. إذا كنت ترغب في معرفة المزيد عن عملنا ، يرجى النقر هنا.

إذا وجدت PNRD مفيدًا واستخدمته في بحثك ، فيرجى الاستشهاد بنا في مقالتك: Xin Yi و Zhenhai Zhang و Yi Ling و Wenying Xu * و Zhen Su *. (2014) PNRD: قاعدة بيانات RNA نباتية غير مشفرة. بحوث الأحماض النووية.دوى: 10.1093 / nar / gku1162. [رابط]


Hacquard S و Garrido-Oter R و González A و Spaepen S و Ackermann G و Lebeis S وآخرون. الكائنات الحية الدقيقة والتغذية المضيفة عبر الممالك النباتية والحيوانية. مضيف الخلية والميكروب. 201517 (5): 603–16.

Finkel OM ، Castrillo G ، Herrera Paredes S ، Salas González I ، Dangl JL. فهم واستغلال الميكروبات المفيدة للنبات. Biol النبات بالعملة. 201738: 155-63.

إدواردز J ، جونسون سي ، سانتوس-ميديلين سي ، لوري إي ، بوديشيتي إن كيه ، بهاتناغار إس ، وآخرون. هيكل وتنوع وتجميع الميكروبات المرتبطة بالجذر في الأرز. Proc Natl Acad Sci U S A. 2015112 (8): E911–20.

Lundberg DS ، Lebeis SL ، Paredes SH ، Yourstone S ، Gehring J ، Malfatti S ، وآخرون. تحديد جوهر الميكروبيوم أرابيدوبسيس ثاليانا جذر أرابيدوبسيس. طبيعة سجية. 2012488 (7409): 86-90.

Castrillo G ، Teixeira PJPL ، Paredes SH ، Law TF ، de Lorenzo L ، Feltcher ME ، et al. تدفع الكائنات الحية الدقيقة الجذرية التكامل المباشر بين إجهاد الفوسفات والمناعة. طبيعة سجية. 2017543 (7646): 513-8.

Berendsen RL ، Vismans G ، Yu K ، Song Y ، de Jonge R ، Burgman WP ، وآخرون. التجمع الناجم عن المرض لاتحاد بكتيري مفيد للنبات. ISME J. 201812 (6): 1496-507.

Bulgarelli D، Schlaeppi K، Spaepen S، Ver Loren van Themaat E، Schulze-Lefert P. هيكل ووظائف الميكروبات البكتيرية للنباتات. Annu Rev Plant Biol. 201364 (1): 807–38.

فيتزباتريك كر ، كوبلاند ج ، وانج بي دبليو ، جوتمان دي إس ، كوتانين بي إم ، جونسون إم تي جي. التجميع والوظيفة البيئية للميكروبيوم الجذري عبر أنواع نباتات كاسيات البذور. Proc Natl Acad Sci U S A. 2018115 (6): E1157–65.

كليرونوموس ج. تساهم التغذية الراجعة مع الكائنات الحية في التربة في ندرة النباتات والغزو في المجتمعات. طبيعة سجية. 2002417 (6884): 67-70.

DA Inderjit W، Karban R، Callaway RM. النظام البيئي والسياقات التطورية للعلاج الأليلوباثي. اتجاهات Ecol Evol. 201126 (12): 655-62.

Lau JA و Puliafico KP و Kopshever JA و Steltzer H و Jarvis EP و Schwarzländer M et al. الاستدلال من allelopathy معقد بسبب تأثيرات الكربون المنشط على نمو النبات. فيتول جديد. 2008178 (2): 412–23.

Bever JD، Westover KM، Antonovics J. دمج مجتمع التربة في ديناميات مجموعات النباتات: فائدة نهج التغذية الراجعة. ي إيكول. 199785 (5): 561-73.

Mangan SA و Schnitzer SA و Herre EA و Mack KML و Valencia MC و Sanchez EI et al. تتنبأ التغذية المرتدة السلبية بين النبات والتربة بالوفرة النسبية لأنواع الأشجار في الغابة الاستوائية. طبيعة سجية. 2010466: 752.

Amundson R ، Berhe AA ، Hopmans JW ، Olson C ، Sztein AE ، Sparks DL. علم التربة. التربة والأمن البشري في القرن الحادي والعشرين. علم. 2015348 (6235): 1261071.

Hartman K و van der Heijden MGA و Wittwer RA و Banerjee S و Walser J-C و Schlaeppi K. تتلاعب ممارسات المحاصيل بأنماط وفرة أعضاء ميكروبيوم التربة والجذور مما يمهد الطريق للزراعة الذكية. ميكروبيوم. 20186 (1): 14.

Li X و Jousset A و de Boer W و Carrión VJ و Zhang T و Wang X et al. يحدد تاريخ استخدام الأراضي إعادة برمجة فسيولوجيا النبات بواسطة ميكروبيوم التربة. ISME J. 201913 (3): 738–51.

George T، Magbanua R، Garrity DP، Tubaña BS، Quiton J. الفقد السريع لمحصول الأرز المحصول على التوالي في التربة الهوائية. أغرون ج. 200294: 981-9.

Peng S، Bouman B، Visperas RM، Castañeda A، Nie L، Park H-K. مقارنة بين الأرز الهوائي والفيضان في المناطق المدارية: الأداء الزراعي في تجربة ثمانية مواسم. الدقة المحاصيل الحقلية. 200696 (2): 252-9.

Nie L و Peng S و Bouman BAM و Huang J و Cui K و Visperas RM وآخرون. التخفيف من مرض التربة الناجم عن الزراعة الأحادية الهوائية: استجابات الأرز الهوائي لتسخين التربة بالفرن. تربة النبات. 2007300 (1): 185-95.

Hu L و Robert CAM و Cadot S و Zhang X و Ye M و Li B وآخرون. تدفع مستقلبات إفرازات الجذر التغذية المرتدة من تربة النبات على النمو والدفاع عن طريق تشكيل ميكروبات الغلاف الجذور. نات كومون. 20189 (1): 2738.

Mackelprang R و Grube AM و Lamendella R و EDC J و Copeland A و Liang C وآخرون. بنية المجتمع الميكروبي والإمكانات الوظيفية في تربة البراري الطويلة المزروعة والمحلية في الغرب الأوسط للولايات المتحدة. ميكروبيول أمامي. 20189: 1775.

Santos-Medellín C و Edwards J و Liechty Z و Nguyen B و Sundaresan V. ينتج عن الإجهاد الناتج عن الجفاف إعادة هيكلة خاصة بالمجموعات الميكروبية المرتبطة بجذر الأرز. MBio. 201718 ، 8 (4): e00764–17.

Edwards JA و Santos-Medellín CM و Liechty ZS و Nguyen B و Lurie E و Eason S et al. التحولات التركيبية في الجراثيم البكتيرية والبدئية المرتبطة بالجذور تتبع دورة حياة النبات في الأرز المزروع في الحقول. بلوس بيول. 201816 (2): e2003862.

شلاتر دي سي ، باكر إم جي ، برادين جم ، كينكل إل إل. ثراء المجتمع النباتي والتفاعلات الميكروبية تبني المجتمعات البكتيرية في التربة. علم البيئة. 201596 (1): 134–42.

Prober SM و Leff JW و Bates ST و Borer ET و Firn J و Harpole WS وآخرون. يتنبأ التنوع النباتي بتنوع بيتا وليس تنوع ألفا لميكروبات التربة عبر الأراضي العشبية في جميع أنحاء العالم. ايكول ليت. 201518 (1): 85-95.

Lee HJ ، Jeong SE ، Kim PJ ، Madsen EL ، Jeon CO. توزيع عمق عالي الدقة للبكتيريا ، العتائق ، الميثانوتروف ، والميثانوجينات في التربة السائبة وجذريات حقول الأرز المغمورة. ميكروبيول أمامي. 20156: 639.

Sekiguchi Y، Yamada T، Hanada S، Ohashi A، Harada H، Kamagata Y. Anaerolinea thermophila gen. نوفمبر ، س. نوفمبر و Caldilinea aerophila gen. نوفمبر ، س.نوفمبر ، روايات حرارية خيطية تمثل سلالة غير مثقفة سابقًا من بكتيريا المجال في مستوى subphylum. Int J Syst Evol Microbiol. 200353 (Pt 6): 1843–51.

Kreye C ، Bouman BAM ، Faronilo JE ، Llorca L. أسباب مرض التربة التي تؤثر على نمو النبات المبكر في الأرز الهوائي. الدقة المحاصيل الحقلية. 2009114 (2): 182-7.

Ma Y ، Zhang M ، Li Y ، Shui J ، Zhou Y. Allelopathy of Rice (Oryza sativa L.) إفرازات الجذر وعلاقاتها مع Orobanche cumana Wallr. و Orobanche طفيفة Sm. إنبات. J مصنع التفاعل. 20149 (1): 722-30.

Garrido-Oter R و Nakano RT و Dombrowski N و Ma K-W و AgBiome Team و AC MH وآخرون. الصفات المعيارية للميكروبات الجذرية الجذرية وعلاقتها التطورية مع الجذور التكافلية. ميكروب مضيف الخلية. 201824 (1): 155-67 هـ.

Yatsunenko T و Rey FE و Manary MJ و Trehan I و Dominguez-Bello MG و Contreras M et al. يتم عرض ميكروبيوم الأمعاء البشرية عبر العمر والجغرافيا. طبيعة سجية. 2012486 (7402): 222.

ميكروبيوم Segata N. Gut: التغريب واختفاء التنوع المعوي. كور بيول. 201525 (14): R611–3.

Martínez I و Stegen JC و Maldonado-Gómez MX و Eren AM و Siba PM و Greenhill AR وآخرون. الميكروبات المعوية لسكان بابوا غينيا الجديدة الريفية: التكوين وأنماط التنوع والعمليات البيئية. ممثل الخلية .201511 (4): 527–38.

كلايتون جي بي ، فانجاي بي ، هوانغ إتش ، وارد تي ، هيلمان بي إم ، الغاليث جي إيه ، وآخرون. الأسر يؤنس الميكروبيوم الرئيسي. Proc Natl Acad Sci U S A. 2016113 (37): 10376–81.

Bodelier PL ، Roslev P ، Henckel T ، Frenzel P. التحفيز بواسطة الأسمدة القائمة على الأمونيوم لأكسدة الميثان في التربة حول جذور الأرز. طبيعة سجية. 2000403 (6768): 421-4.

Neue H-U. انبعاث غاز الميثان من حقول الأرز. العلوم البيولوجية. 199343 (7): 466–74.

وكالة حماية البيئة في الولايات المتحدة ، انبعاثات غاز الميثان وأكسيد النيتروز من المصادر الطبيعية 2012. ص. 1–196.

Zhang Z و Zimmermann NE و Stenke A و Li X و Hodson EL و Zhu G et al. الدور الناشئ لانبعاثات غاز الميثان في الأراضي الرطبة في إحداث تغير مناخي في القرن الحادي والعشرين. Proc Natl Acad Sci U S A. 2017114 (36): 9647-52.

لو واي ، كونراد ر. في الموقع سوب. فحص نظائر الجدول للعتائق الميثانوجينية في ريزوسفير الأرز. علم. 2005309 (5737): 1088-1090.

Sakai S ، Imachi H ، Hanada S ، Ohashi A ، Harada H ، Kamagata Y. Methanocella paludicola gen. نوفمبر ، س. نوفمبر ، أركيون منتج للميثان ، والعزلة الأولى من سلالة "مجموعة الأرز 1" ، واقتراح النظام البدائي الجديد Methanocellales ord. نوفمبر Int J Syst Evol Microbiol. 200858 (Pt 4): 929–36.

Erkel C ، Kube M ، Reinhardt R ، Liesack W. Genome of Rice Cluster I archaea - المنتجون الرئيسيون للميثان في منطقة جذور الأرز. علم. 2006313 (5785): 370-2.

Simmonds MB ، Anders M ، Adviento-Borbe MA ، van Kessel C ، McClung A ، Linquist BA. انبعاثات غاز الميثان وأكسيد النيتروز الموسمية للعديد من أصناف الأرز في أنظمة البذر المباشر. J البيئة كوال. 201544 (1): 103.

Zhang J و Zhang N و Liu Y-X و Zhang X و Hu B و Qin Y وآخرون. يرتبط تحول الجراثيم الجذرية في الأرز بوقت الإقامة في الحقل ومرحلة النمو. Sci China Life Sci. علوم الحياة في الصين. 201861 (6): 613–21.

Edwards J و Santos-Medellín C و Sundaresan V. Extraction و 16S rRNA تحليل تسلسل للميكروبات المرتبطة بجذور الأرز. البروتوكول الحيوي. 20188 (12): e2884.

Masella AP ، Bartram AK ، Truszkowski JM ، Brown DG ، Neufeld JD. PANDAseq: مُجمّع ذو طرف مزدوج لتسلسلات Illumina. المعلوماتية الحيوية BMC. 201213 (1): 31.

Al-Ghalith GA، Montassier E، Ward HN، Knights D. NINJA-OPS: محاذاة جينية سريعة ودقيقة باستخدام الريبوسومات المتسلسلة. ايزن جا ، محرر. بلوس كومبوت بيول. 2016 12 (1): e1004658.

فريق R Core. R: لغة وبيئة للحوسبة الإحصائية. فيينا: مؤسسة R للحوسبة الإحصائية 2016.

Benjamini Y، Hochberg Y. التحكم في معدل الاكتشاف الخاطئ: نهج عملي وقوي للاختبارات المتعددة. طريقة الإحصاء J R Stat Soc Series B Stat. 199557 (1): 289-300.

Love MI ، Huber W ، Anders S. تقدير معتدل لتغيير الطية والتشتت لبيانات RNA-seq باستخدام DESeq2. جينوم بيول. 201415 (12): 550.

McMurdie PJ، Holmes S. لا تضيعوا ، لا تريدون: لماذا لا يُسمح بتخلخل بيانات الميكروبيوم. بلوس كومبوت بيول. 201410 (4): e1003531.

Dixon P. VEGAN ، مجموعة وظائف R لبيئة المجتمع. J فيج سسي. 200314: 927-30.

كوزنتسوفا أ ، بروكهوف بي بي ، كريستنسن آر إتش بي. حزمة lmerTest: اختبارات في نماذج التأثيرات المختلطة الخطية. J Stat Softw. 201782 (13): 1–26.

Cribari-Neto F ، Zeileis A. انحدار بيتا في R.J Stat Softw. 201034 (2): 24.

McMurdie PJ ، Holmes S. Phyloseq: حزمة R للتحليل التفاعلي القابل للتكرار والرسومات لبيانات تعداد الميكروبيوم. بلوس واحد. 2013228 (4): e61217.

Wickham H. ggplot2: رسومات أنيقة لتحليل البيانات. نيويورك: Springer-Verlag 2016.

Edwards J ، Santos-Medellin C ، Nguyen B ، Kilmer J ، Liechty Z ، Veliz E ، Ni J ، Phillips G ، Sundaresan V. تأثير تدجين التربة على الميكروبات الجذرية لنباتات الأرز. NCBI. تسلسل قراءة الأرشيف. (2019) https://www.ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA548898. تم الوصول إليه في 16 أكتوبر 2019.

Edwards J، Santos-Medellin C، Sundaresan V. البيانات الخاصة بـ: تدجين التربة عن طريق زراعة الأرز ينتج عنه تغذية مرتدة للتربة النباتية من خلال التحولات في الكائنات الحية الدقيقة للتربة (الإصدار 1.0). مجموعة البيانات زينودو. 2019. https://doi.org/10.5281/zenodo.3372822.

Edwards J، Santos-Medellin C، Nguyen B، Kilmer J، Liecht، Z، Veliz E، Ni J، Phillips G، Sundaresan V. تدجين التربة عن طريق زراعة الأرز ينتج عنه تغذية مرتدة للتربة النباتية من خلال التحولات في الكائنات الحية الدقيقة للتربة. مصدر الرمز. جيثب. 2019. https://github.com/bulksoil/SoilDomestication. تم الوصول إليه في 16 أكتوبر 2019.


متشابهة لكن مختلفة

لقد أخبرناك للتو عن العديد من الاستثناءات لبنية النبات الأساسية ، لذلك دعونا نلقي نظرة على بعض أوجه التشابه. يوجد تشابه سهل على المستوى الخلوي. تقوم النباتات بعملية التمثيل الضوئي. تحدث عملية تحويل طاقة الشمس إلى طاقة جزيئية في البلاستيدات الخضراء بمساعدة جزيئات الكلوروفيل ومجموعة متنوعة من الإنزيمات. تشترك النباتات الوعائية في مجموعة مماثلة من الهياكل تسمى الجذور والسيقان والأوراق. العديد من النباتات لها إصدارات متخصصة ، ولكن الأساسيات موجودة. قد يكون أحد التخصصات هو بتلات الزهرة. بتلات الزهور تلك عبارة عن أوراق متخصصة تحيط بالتركيبات التناسلية للنبات.


الاختصارات

NACعامل النسخ NAM و ATAF و CUC
WRKYعائلة عامل نسخ عزر WRKY
MYBعائلة عامل نسخ داء الأرومة النقوية
ATHB6نبات الأرابيدوبسيس thaliana عامل النسخ homobox 6
إصبع الزنك C2H2Cys (2) عائلة عامل نسخ إصبع الزنك
bZIPعامل نسخ سحاب الليوسين الأساسي
AP2 / EREBPعامل النسخ APETALA2 / ETHYLENE RESPONSE ELEMENT2
ABAحمض الأبسيسيك
GRASعائلة عامل نسخ GAI و RGA و SCR
BHLHعامل النسخ الحلزوني الحلزوني الأساسي
C2C2 (DOF)Cys (2) Cys (2) ارتباط الحمض النووي بإصبع واحد من عامل نسخ إصبع الزنك
سورليبالتسلسل تم تمثيله بشكل مفرط في المحفزات التي يسببها الضوء
DPBFدي سي 3 موقع التعرف على عامل ربط المروج
ARFعامل استجابة أوكسين

ملفات إضافية

مراحل تطور الأوراق.

مراحل تطور الفلقة.

تحليل المكون الرئيسي للتعبير الجيني للأوراق والنبتات.

بيانات العد الطبيعية لجميع الجينات في أنسجة الأوراق والنباتات.

الجينات المعبر عنها تفاضليًا وقيم التعبير المقيسة للدورات الزمنية التنموية للأوراق والنباتات مع التعليقات التوضيحية.

قيم التعبير المعياري لـ Homologs لجينات Arabidopsis Senescence المرتبطة في الأوراق والنبتة.

شروط GO المخصبة للجينات المعبر عنها بشكل مشترك.

قيم التعبير المعياري للجينات المشاركة في نقل النيتروجين والكبريت والبوتاسيوم والفوسفور.

جينات الأنسجة المحددة.

الجينات المعبر عنها تفاضليًا الشائعة بين الورقة والنبتة.

قيم التعبير المعياري للجينات المشروحة في NAC في الأوراق و cotlyedon.


شاهد الفيديو: إذا رأيت هذا النبات في حديقتك فلا تقطعه (كانون الثاني 2022).